Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69916	CC1CCCCCC1.O=CC1=C(C[C@H](O)[C@@H](O)C(=O)OC(=O)C(=O)O)CCC1=C1CCOC1	TargetDiff	5AHW	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69917	O=C1C=C(F)C=C2C1C=C1C(C(=O)N3C(=O)Cc4ccncc43)OC(=O)C1C2O	TargetDiff	5AHW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69918	CC1=NN=C(C(O)C(=O)N2CCC(=O)NC3C=Cc4cc(OC(F)(F)F)ccc4C3C2)NC1C	TargetDiff	5AHW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69919	CC1=CC=C2C3C1=NC(=O)C1C(=O)NC=CC1=C3C1CCC(=O)N21	TargetDiff	5AHW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69920	CC(=O)OC1OCC(O)(C(O)C(O)C(=O)NC2=NC(=N)N=CC2N)O1	TargetDiff	5AHW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69921	CCC1OC(C)(C(=O)O)OC(O)(CO)C1OC(=O)C1N=CC=C(O)C1C	TargetDiff	5AHW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69922	C[C@@H](CO)N(CO)[C@@H](CN)C(=O)N(O)CC=C=CCC=C1Cc2oc(=O)c(=O)n(C)c2C1	TargetDiff	5AHW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69923	CCC1C=CCC2OC1CC(O)C(C)C(C(=O)O)C(O)C2c1ccncc1	TargetDiff	5AHW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69924	COC1=CC2OC(=O)C3C(O)C(O)CCOC3(O)C2C=CC1C	TargetDiff	5AHW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69925	CC(=O)C1C(=O)C2=C(C(CP(=O)(O)O)C3=C4CCC(O)C4C(O)C(O)C23)N1C	TargetDiff	4YSL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69926	CC(C(=O)O)C1CCCC2(O)CCCC3C4=CC(C(=O)O)=CCC=C4C(=O)C1C32	TargetDiff	4YSL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69927	CC1C2NCC(O)C2C2CC(O)(CC(=O)CCO)C(O)C12O	TargetDiff	4YSL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69928	O=C1CC2=C(CCC2=CO)C[C@@H]2Cc3cnccc3ON12	TargetDiff	4YSL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69929	O=C(O)C1CCC(C(=O)NC2C=Cc3ncncc3C2COc2ccccc2)C1	TargetDiff	4YSL	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69930	O=C1OC(CC(O)CCC2=CC(CO)C(O)C(O)C2)CC(O)C1O	TargetDiff	4YSL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69916 to 69930 of 73725 items. Total 4915 pages.