Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
72601	CNCCCNC(O)(C1C=CCC(OC)=C1)C1CCC2C(F)=CC=CC=C21	TargetDiff	5DQF	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72602	NC(=O)c1ccc(C2(CCO)CC3C=CC(Cl)=CC3C2=O)cc1	TargetDiff	5DQF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72603	COC1=CCC(C(C(=O)NN)c2ccccc2F)=CC1	TargetDiff	5DQF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72604	CCCC1NCN(CCC2CCC(C)(C)CC2)C1C(=O)NC	TargetDiff	5DQF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72605	CC(=O)C1=C2C=C(C)C(=O)C3=C2C(C1)C1=CCC=CC1C3	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72606	CC1N/C=C\c2c(O)ccc3oc4c(C5=CNN=CN=C5)ccc1c4c23	TargetDiff	6K3L	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72607	CC1=C2NC3=NC(=O)C4=CC=CC5=C=C/C=C(/C=N1)C2N3C54	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72608	CC(CO)C(=O)C1C2=C(c3ccccc3C2)N(N)c2cc(Cl)ccc21	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72609	CC1=CCC=CC1N/C1=C/C(O)CCC2=COCCC2N1C	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72610	CC1NC(=O)C2=NC(=O)C=C3C=C(C(=O)O)C(C)C4=C(NC(CC4C)O1)C32	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72611	CC1CCC(=O)N(C)C1C1C=CC2=NC(=N)N=C2C(C2C=CC(O)C=C2)=C1	TargetDiff	6K3L	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72612	N=C1C=C2C=C3C4C(=C(OO)C=CC4=C2C=N1)C=C1CCCN13	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72613	O=C1C=C=c2c(O)c(Cl)cc3sc4c(c23)C(=CC=CC=4)/C=C/1	TargetDiff	6K3L	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72614	O=C(O)C1OC2(O)OC1C(CO)OCC(O)C2O	TargetDiff	4XAR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
72615	CC(O)(O)CC(NO)C(=O)O	TargetDiff	4XAR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

72601 to 72615 of 73725 items. Total 4915 pages.