Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73711	CCCC1C(O)C(O)(C(=O)O)OC1(O)COC1CC2(C)CC(CCNC(=O)OC)CCOC(C)C2(O)C(O)C(O)C1C(=O)O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73712	CC1CC(=O)C(CNCS(O)(O)c2cccc(C3CNC(=O)C3)c2)N1CC(CO)C(=O)N(CC(=O)O)C(CO)CO	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73713	CCOC1=NCN(C(C2C=CCC=C2)C(C)(O)C(O)C(=O)OCP(=O)(O)O)C(=O)N1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73714	CC(N)CN1CCC(O)(C(C)C2c3ccccc3NN2C(COC2CCC(=O)O2)c2ccccn2)C1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73715	N=C1CCC(C(=O)OC2CC(C(=O)O)OC(c3cccc(F)c3)CC2(O)O)C1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73716	COC1=CC(=C2N=CCC=C2Cl)C(c2ccnc(C(=O)NC(O)(O)C(N)=O)c2)C=C1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73717	CC(O)CSCCCC1C=CCC(=O)CC1C(C)C(O)CCCC(=O)O	TargetDiff	6UDI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73718	COc1cccc2c1C=CC=NC2C1(C(O)c2cccnc2)C=CC(F)=CC1	TargetDiff	6UDI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73719	CC1CC(C2CC(C(=O)O)C3c4cccc5c4C(CC5)C(=O)C(C)C23)CO1	TargetDiff	6UDI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73720	CC1=C(O)C=C2C(OCC(C)C2C2COC(Cl)C2)C1C	TargetDiff	6UDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73721	COC1=C=C2CC(C)C(O)=C2C(C)SC(Cl)/C(N2C=CCC=C2)=N\1	TargetDiff	6UDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73722	CC1C=CN=C2C(NC3=C(F)C=NC(c4ccccc4)C23)C1C.OCOC1C=CC=CC=C1	TargetDiff	6UDI	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73723	CCc1cc(C)cc(C(=CC(=O)O)c2ccc(F)cc2)c1	TargetDiff	6UDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73724	Cc1cc2c(cc1C)[C@@H](C)C[C@@](O)([C@@H](CCC=CC(C)Cl)C(F)F)O2	TargetDiff	6UDI	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73725	OC=C1C=C(N2CCCC2)C=C(N2N=CCCC3=C2C=CCC3)C1	TargetDiff	6UDI	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

73711 to 73725 of 73725 items. Total 4915 pages.