Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73666	CC1=CC(N2C(=O)C(C)C(O)C(C3CNC(C)C3)CCC(O)C(C3C=CC(=O)N=C3)C2=O)CN1	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73667	NCC(O)OC1CC2=C(C1)C(C(=O)O)C(NCCC(C(=O)O)C(O)CO)C=C2F	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73668	CCN(C)C(C(=N)NCC1OCCC1(O)CC(C(C)O)C(C)CC(O)(O)CN)C1CCCN1	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73669	O=C(O)C(=O)NOC1(O)CC(C(=O)O)OC2C(C3=CC=NN(O)C3)c3ccccc3C21	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73670	CC1NC(=O)N2C3CC(O)C(COC(=O)NC(=O)CC(=O)O)N3C(=O)C12C	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73671	CC(O)C(F)C(O)C(O)C1OCC2CC(P(=O)(O)O)OCC2OC(CCC(=O)O)O1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73672	COC1=CC2C(=CC1)C(C(=O)O)NC(C)CCOC(C(O)C(C)P(=O)(O)O)CN1NC(C)=C2N1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73673	O=C(O)C(O)C1OC2=C=C(C=CN=C2)N2C(=O)CC(C(=O)N3CCCC(N4CC=C(O)CC4)C3)C=C2C(c2ccccc2)O1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73674	CC(CCOCCOCC(=O)O)C1C=C(O)CC=CC1C1C(F)C=CCC1C(=O)NC(N)=O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73675	CCC1(O)NC2COCC3OC4OC(CC(O)C4OC(=O)CC2C1(O)O)C1(CC(N)=O)OC3(O)C1CO	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73676	O=C1OC(O)CC(O)C1C(O)P(=O)(O)C(O)C(O)CCP(=O)(O)O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73677	CC(OCCC(O)C(N)C(=O)O)C(=O)NCCC(CO)C(=O)O	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73678	C=Cc1ccc(O)c(OC(=O)CC2N(C(=O)C(=O)O)C3CC4NCCC4C3S2(O)O)c1NS(C)(O)O	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73679	O=C(CO)N(CO)C(=O)COC1COC2(C(=O)O)C3CC(O)(CO)CC3CN12	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73680	CC(O)CNc1ccc2c(c1)C(C)C(=O)N1C(=O)C(CCS(N)(O)O)CC3CC=CC2C31	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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