Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73606	CCCC1=C(S(O)(O)O)C(C2CC(O)=C(C3CC=NC(C)=N3)S2)C(Cl)C=C1	TargetDiff	4RWW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73607	CC1C(=O)NCCC(O)C1C.CC1C=CCC=C1C1(OC(N)(O)O)CC2CCC1C(C)C2	TargetDiff	4RWW	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73608	CC(C(=O)O)N(C)CC1CC=CC(C(N)=O)C1CCC1CCOC1	TargetDiff	4RWW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73609	OC1CC2(O)CCCC2C(O)C1(O)C1=CC(Cl)C=CC1OS(O)(O)O	TargetDiff	4RWW	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73610	CC(C)(O)CC1CC=C=C2CCN/C2=N\CCc2ccccc2C(S(O)(O)O)CC(=O)N1	TargetDiff	4RWW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73611	CC(C(=O)O)C1C(C(=O)O)=CCC2CC(=O)/C(NC=C=C3CONN3C)=N\CC(=C=O)C21	TargetDiff	4RWW	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73612	CC1CCC(CC(=O)N2CCO2)N1.COCC(CS)C(C)C(N)=O	TargetDiff	4RWW	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73613	COC1=CC2CC3=C(NC(C4C(S)=CC=C(OC)C4C(=O)O)O3)C2=CC1	TargetDiff	6EZQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73614	COC(=O)C1NC(C(C)NO)=NC(C)C1C(C)c1c(O)cc2cc(O)ccc2c1N(CO)C(=O)CO	TargetDiff	6EZQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73615	CC(O)CC1=CC(CC2Oc3ccc(F)cc3NC2=O)C(NS(O)(O)O)CCN1	TargetDiff	6EZQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73616	Cc1cccc(NN2CNCC2C(C)CC(F)F)c1OCC(C)NC(=O)C(CC1CC(C(=O)c2ccccc2)CN1)NP(=O)(O)O	TargetDiff	6EZQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73617	COc1cc(=NC(=O)[C@@H](OC(=O)O)[C@@H]2CCO2)os1	TargetDiff	6EZQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73618	COCC1(O)COC2CC=C3C=C(N(C)C)C4C=CC(=CC4=C3C2c2cccnc2)NC(O)C(O)(O)CNC(=O)N1	TargetDiff	6EZQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73619	CCn1c(C(C)C)nc2c1N=CC(C1CC(C(=O)O)CCCO1)C=C2	TargetDiff	6EZQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73620	CC1=CC=C(O)C2C1=CC(C(=O)O)=CC2C1C(O)=CC2C(=C1O)CC(=O)N2C	TargetDiff	6EZQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

73606 to 73620 of 73725 items. Total 4915 pages.