Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73636	CC(OCC(O)(O)C(=O)O)C1(O)CCC(C(O)(O)C(N)CC2CCCCC2(F)F)O1	TargetDiff	5LOM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73637	CC12CCCC(O)C1CCC(C1OC(C(O)CC3C4CC5CC(CN4)C3C5)C(O)C1O)C2	TargetDiff	5LOM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73638	CC1(F)CCCC2C(O)CC(C3(C(=O)O)NC(C(O)C4CCCCC4)CO3)NC2(C)C1	TargetDiff	5LOM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73639	CC(CC(=O)CCNC(CNC1CCC2CCC3CCC31C2)C(=O)O)N1CCC=CC2NC(F)CC21	TargetDiff	5LOM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
73640	O=C(NC(=O)[C@@H]1CCCC[C@@H](OC(=O)[C@H](CCC=C2C[C@@H](CF)CCN2NONC(F)(F)F)C(=O)O)NC1)c1ccccc1	TargetDiff	5LOM	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73641	C[C@@H]1C[C@H]([C@@H](F)O[C@](O)(N=C[C@H]2CC[C@H]3C[C@](C)(C3)C2=O)C(=O)O)CC[C@]1(C)O	TargetDiff	5LOM	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73642	CC(CO)NC(=O)OC(=O)C(O)C1(O)C(O)C(O)C(F)(F)C(F)(F)C1O	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73643	O=C1CC(O)C(O)(CO)CC2=C(O)CCCC12	TargetDiff	4XMR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73644	O=C(O)C1CC(CC(F)CC(F)F)C(O)C1O	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73645	N=C(OC(=O)N=C1C=CCC=C1)[C@H](O)c1ccc(F)cc1O	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73646	O=C(O)CC(=CCO)COCO.O=C1CCCC[C@@H](F)[C@H]2[C@H]1CO[C@H](F)[C@H]2O	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73647	CC1COC(=O)C2(O)CC3=C(CC(O)C3)C(C)C12.OCc1ccnc2c1N=CNC=C2	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
73648	CC(O)C1=C(O)COC2C(CC(=O)O)C(O)C(O)C12O	TargetDiff	4XMR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73649	OC1=C(C(O)C(O)CCC2=C(O)CC=CC2)CCC=C1	TargetDiff	4XMR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73650	CCC(F)CC1(F)C(N)C(F)=C(CF)C2C1C(O)CC(F)C2(F)F	TargetDiff	4XMR	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔

73636 to 73650 of 73725 items. Total 4915 pages.