Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73696	COC1CCC(C(CN(CC2CCCC(CO)N2C(C)=O)C(=O)C(C)C2COC(C(F)C(O)(O)O)C2)C(O)C(O)C(C)C(=O)O)C1	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73697	CN(C)C(=O)CC(O)C(CC(O)CO)OCC12COCC3C=C4C=CC5C=CCC=CC5C4(S)CC(C(CC(O)(O)O)O1)N32	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73698	CC1CC2C(O)CCC3CC(C(C)(C)O)CCC(C1C(=O)OCCCC(N)(O)CN)C32	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73699	CNCCOC1C=C(Cl)C=C2OC3=C(CC(C)(O)O)CN=CN3C2C1OCCCCN	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73700	CC(O)C(C(=O)OC(=O)C(CN)N(C)O)C1SCC(=O)OC1OC(=O)C(=O)OC1CNCC1P(=O)(O)O	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73701	C=C(C)C(O)CC(C)C(=O)NOC(C)C1CCNc2c1ccc(O)c2O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73702	COC1NC(Oc2cccc(O)c2)C(O)CCOC(=O)CNC(C(O)C(C)CCO)OC1=O	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73703	CC(=O)OC1CC(COC(C)C2(C(C)O)OCCC2C)CC2CCC(C(O)(O)CCN)C2C1C	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73704	Cc1cc(C2CNC(=O)N2CC2(O)CCN(c3ccccc3)CC2O)ccn1	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73705	CCC(O)(CO)C(C(O)C(CO)C1CC(O)C(CC(N)=O)C(=O)O1)S(=O)OC	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73706	CC(O)C(C)C(C)C(C)(O)CC(C(=O)O)C(=O)OC(=O)C(=O)NC(=O)CC(=O)O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73707	O=C1C(OO)CC(CC2c3ccccc3N=C(CC3CC(O)C(O)N3)C2C(=O)O)C1O	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73708	CCC(C)C(O)C1OC(OC(=O)CCC(=O)O)C(C)C2Oc3ccc(N)cc3OC21	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73709	CC(=N)CCC1C(C(O)C(C)O)=NC(c2ccc(F)c(F)c2)CC1C(N)=O	TargetDiff	4IIY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73710	CC1C(N(C(C)CO)C2OC(O)(C3=CN(C(=O)O)C(C(=O)OP(C)O)OC(=O)C3O)C(O)C(O)COC2=O)OCN1C	TargetDiff	4IIY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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