Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
13831	COc1cc(CN2CCN(c3cc(C(C)(C)O)ccc3Cl)CC2)ccc1C(=O)NC1CCCCN(c2ccccc2)C1	AlphaDrug	6MUB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13832	COc1cc(N2CCN(C(=O)Cc3ccccc3)CC2)ccc1C(=O)Nc1cc(-c2ccc(C)c(C(F)(F)F)c2)cc(C(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6MUB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13833	COc1cc(CN2CCN(c3ccc(C(C)(C)C)cc3)CC2)ccc1C(=O)NC1CCCCN(c2ccccc2)C1	AlphaDrug	6MUB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13834	COc1cc(CN2CCN(c3cc(C(=O)N4CCC(c5ccc(F)cc5)CC4)ccc3Cl)CC2)cc(-c2ccc(F)cc2F)c1	AlphaDrug	6MUB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13835	COc1cc(CN2CCN(c3cc(C(=O)N4CCN(c5ccc(Cl)cc5)CC4)ccc3Cl)CC2)cc(-c2ccccc2)c1	AlphaDrug	6MUB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13836	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4ccc(F)c(C(F)(F)F)c4)n3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13837	Cc1ccc(OC2C=CN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4ccc(N5CCOCC5)cc4)n3)CC2)c(C)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13838	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4ncnc5nc(C)ncc45)n3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13839	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4ccc(C(=O)O)cc4)n3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13840	Cc1ccc(-c2cccc(NS(=O)(=O)c3ccccc3)c2)cc1NC(=O)N(C)C1CCCCC1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13841	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(Nc4ccc(N5CCN(C)CC5)cc4)cc(C(F)(F)F)c3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13842	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4ccc(N5CCN(S(=O)(=O)C6CC6)CC5)cc4)n3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13843	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C4CCCC4)nc(NCc4ccc(N5CCCC5)cc4)n3)CC2)cc1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13844	Cc1ccc(OC2CCN(c3cc(C(F)(F)F)cc(Nc4cc(F)cc(C(F)(F)F)c4)n3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13845	CN(C(=O)Nc1cccc(-c2cccc(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccccc4)c3)c2)c1)C1CCCCC1	AlphaDrug	4G3D	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

13831 to 13845 of 73725 items. Total 4915 pages.