Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
16066	CC(CNC(=O)c1ccc(-c2ccccc2)c2ccccc12)C(=O)NC(=O)N1CCN(c2ccccn2)CC1	AlphaDrug	5A81	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16067	CC(CNC(=O)c1ccc(-c2ccccc2)c2ccccc12)C(=O)NC(=O)NC(=O)c1cccc2ccccc12	AlphaDrug	5A81	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16068	CCC1CCCC(NC(=O)C(C)CNC(=O)c2ccc(-c3ccccc3)c3ccccc23)C(=O)N1C	AlphaDrug	5A81	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16069	CC(CNC(=O)c1ccc(-c2cccc(-c3ccccc3)c2)c2ccccc12)C(=O)NC(=O)CSc1ccccc1	AlphaDrug	5A81	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16070	CCC(C)(C)OC(=O)NC(=O)C(C)CNC(=O)c1ccc(-c2ccccc2)c2ccccc12	AlphaDrug	5A81	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16071	Cc1ccc(C(=O)O)cc1COc1ncc(-c2ncnc3[nH]c(C#N)cc23)c(NCc2ccccc2)n1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16072	Cc1ccc(C(=O)O)cc1C(=O)NC(CC(=O)NO)c1ccc(N2C=CN(C(=O)Nc3ccc(F)cc3)CC2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16073	COc1ccc(-c2ccc(C(CC(=O)NO)NC(=O)c3cc(C(=O)O)ccc3C)cc2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16074	Cc1ccc(C(=O)NCc2ccccc2)cc1C(=O)NC(CC(=O)NO)c1ccc(N2CCN(C3CC3)CC2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16075	Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1C(=O)NC(CC(=O)NCc1ccccc1)C1CCC(C(=O)O)CC1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16076	Cc1ccc(C(=O)NCc2ccccc2)cc1C(=O)NC(CC(=O)NO)c1ccc(N2CCN(c3cnc(C4CC4)s3)CC2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16077	Cc1ccc(C(=O)NO)cc1COc1ccc(-c2nnc(C3C=CCC(N4CCN(c5ccc(C(F)(F)F)cc5)CC4)CC3)o2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16078	Cc1ccc(C(=O)NCc2ccc(-c3cnnn3C)cc2)cc1C(=O)NC(CC(=O)NO)c1ccc(N2CCCC(O)(C(F)(F)F)C2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16079	Cc1ccc(-c2nccs2)cc1C(=O)NC(CN1CCCCC1)c1ccc(Cl)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16080	Cc1ccc(-n2ncc(CCC(=O)Nc3ccc(C(F)(F)F)cc3)n2)cc1	AlphaDrug	4QP2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

16066 to 16080 of 73725 items. Total 4915 pages.