Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
16036	CC(C)(C)N(Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1)c1nnc(-c2cccc(OC3CCCC3)c2)s1	AlphaDrug	6OE0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16037	CC(C)C(NC(=O)c1cc(-c2ccc(Cl)cc2Cl)ccc1O)c1c[nH]c2ccccc12	AlphaDrug	6OE0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16038	CC(C)(C)c1ccc(N(Cc2cc3ccccc3c(=O)[nH]2)C(C)(C)C)cc1	AlphaDrug	6OE0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16039	CC(C)(C)N(Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1)c1nnc(-c2cccc(O)c2)o1	AlphaDrug	6OE0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16040	CC(C)(C)N(Cc1ccc(C(F)(F)F)cc1)c1nnn(-c2ccccc2)c1CC1CCCCC1	AlphaDrug	6OE0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16041	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3cc4nc(-c5cccc(-c6cnn[nH]6)c5)cc(-c5ccccc5)c4s3)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16042	NS(=O)(=O)c1cccc(-c2cccc(-c3cc4nc(-c5ccccc5)ccc4[nH]3)c2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16043	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3cc4nc(C5CC5)cc(-c5ccc(OC(F)(F)F)cc5)c4cc3Cl)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16044	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3n[nH]c4cc(-c5ccccc5)ccc34)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16045	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3nc4ccc(Cl)cc4[nH]3)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16046	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3n[nH]c4nc(-c5ccccc5)ccc34)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16047	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3cc4nc(-c5ccccc5)cc(-c5ccccc5)c4s3)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16048	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3cc4nc[nH]c4cc3OCC3CCCCC3)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16049	Cn1c(-c2ccncc2)nc2cc(-c3ccc(-c4cccc(S(C)(=O)=O)c4)cc3)c(Cl)cc21	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
16050	CS(=O)(=O)c1cccc(-c2ccc(-c3cc(-c4ccccc4)ccc3C(=O)O)cc2)c1	AlphaDrug	6GWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

16036 to 16050 of 73725 items. Total 4915 pages.