DrugGen

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

The moleculars that cannot be Kekuleized have been excluded.

Section 3: Detailed Test Result Search

id smiles method pdb id PB valid mol pred loaded mol true loaded mol cond loaded sanitization all atoms connected bond lengths bond angles internal steric clash aromatic ring flatness double bond flatness internal energy protein ligand maximum distance minimum distance to protein minimum distance to organic cofactors minimum distance to inorganic cofactors minimum distance to waters volume overlap with protein volume overlap with organic cofactors volume overlap with inorganic cofactors volume overlap with waters
19141 NC(=O)c1cc(-c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)c2cccc(O)c2n1 AlphaDrug 6H8S ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19142 NC(=O)c1cc(-c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)cc(N2CCCC2c2ccccc2)c1 AlphaDrug 6H8S ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19143 NC(=O)c1cc(-c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)c2cc(-c3ccc(O)c(C(F)(F)F)c3)[nH]c2n1 AlphaDrug 6H8S ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19144 NC(=O)c1cc(-c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)c2c(c1)C(c1cccc(OC(F)(F)F)c1)CO2 AlphaDrug 6H8S ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19145 NC(=O)c1cc(-c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)c2scc(O)c2n1 AlphaDrug 6H8S ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19146 NC1=NC(Oc2cccc(-c3ccccc3)c2)NC(=O)OC12CCCCCC2 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19147 NC1=NC(c2ccc(-c3cccc4ccccc34)cc2)NC(=O)OC1=O AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19148 NC1=NC(c2ccccc2C(=O)Nc2ccc(Cl)cc2)NC(=O)O1 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19149 NC1=NC(c2ccc(-c3cccc(-c4cccc(C(F)(F)F)c4)c3)cc2)NC(=O)OC1=O AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19150 NC1=NC(c2ccc(-c3cccc(-c4ccccc4)c3)cc2)NC(=O)NC1=O AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19151 NC1=NC(c2cccc(-c3ccc(N4CCCC4)cc3)c2)NC(=O)O1 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19152 NC1=NC(c2ccc(-c3ccc4ccccc4c3)cc2)NC(=O)O1 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19153 NC1=NC(c2ccc(-c3ccc(N4CCCC4)cc3)cc2)NC(=O)O1 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19154 NC1=NC(c2cccc(-c3ccccc3)c2)NC(=O)OC1=O AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
19155 CC1CC(N)=NC1NC(=O)c1ccc(-c2cccc(N3CCCC3)n2)cc1 AlphaDrug 5HBS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔

19141 to 19155 of 73725 items. Total 4915 pages.