DrugGen

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

The moleculars that cannot be Kekuleized have been excluded.

Section 3: Detailed Test Result Search

id smiles method pdb id PB valid mol pred loaded mol true loaded mol cond loaded sanitization all atoms connected bond lengths bond angles internal steric clash aromatic ring flatness double bond flatness internal energy protein ligand maximum distance minimum distance to protein minimum distance to organic cofactors minimum distance to inorganic cofactors minimum distance to waters volume overlap with protein volume overlap with organic cofactors volume overlap with inorganic cofactors volume overlap with waters
21226 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4cccc(NC(=O)NC(C)(C)c5ccc(C(F)(F)F)cc5)c4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21227 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4cccc(NC(=O)c5ccc(F)cc5)c4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21228 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc(C4(c5ccc(C(F)(F)F)cc5)CC4)cc3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21229 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4[nH]c(NC(=O)C5CCCC5)cc4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21230 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc(CN4CCN(C(=O)N5CCCC5)CC4)cc3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21231 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc(C4=NC(C(=O)O)C4)c(C(F)(F)F)c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21232 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3ccc(CCN4CCCCC4)cc3)c2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21233 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4cccc(NC(=O)Nc5cc(C(F)(F)F)ccc5OC(F)(F)F)c4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21234 Cc1ccc2[nH]c(-c3cccc(-c4cccc5ccccc45)c3)c3c(c1)CCCCCC2C3 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21235 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3ccc(CNC(=O)c4ccc(C(F)(F)F)cc4)cc3)c2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21236 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4cccc(OCCCCC(=O)O)c4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21237 Cc1ccc(S(=O)(=O)N2CCC(c3ccc(C(F)(F)F)cc3)CC2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21238 Cc1ccc(-c2nc3ccc(-c4ccc(N5CCN(C)CC5)cc4)cc3[nH]2)cc1OCCC(=O)O AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21239 Cc1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)C(Cc2ccccc2)C2=CCCCC2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
21240 Cc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(-c3ccc4ccc(C(=O)O)cc4c3)cc2)cc1 AlphaDrug 1AFS ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔

21226 to 21240 of 73725 items. Total 4915 pages.