Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
2191	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccc5c(c4)OCO5)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2192	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6cncc(Cl)c6)cc45)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2193	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6ccc(C7CC7)nc6)cc45)n3)nc2)C=CN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2194	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(C6CC6)cc45)n3)cn2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2195	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc(Nc5ccc(C(F)(F)F)cc5)c4)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2196	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6ccccc6)cc45)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2197	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6cnc7c(c6)CCNC7)cc45)n3)nn2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2198	CC1CN(c2ccc(-c3ccnc(Nc4ccc(C(F)(F)F)cc4)n3)cn2)CC(O)C1O	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2199	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6cnc7ccccc7n6)cc45)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2200	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]nc(-c6ccc(C(F)(F)F)cc6)c45)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2201	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6cnc7ccccn67)cc45)n3)nn2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2202	CC1CN(C(=O)Nc2ccc(-c3ccccc3)cc2)CCN1c1cc(-c2ccnc(N)c2)ccn1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2203	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4cc(N)cc(C(=O)Nc5cc(C(F)(F)F)ccn5)n4)n3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2204	CC1CN(c2ccc(Nc3nccc(-c4ccnc5[nH]c(-c6cnc7[nH]ncc7c6)cc45)n3)nn2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
2205	CC1CN(c2ccc(Nc3ncc(-c4ccnc(Nc5ccc(C(F)(F)F)cc5)n4)s3)nc2)CCN1	AlphaDrug	1FXV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

2191 to 2205 of 73725 items. Total 4915 pages.