Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
38821	COc1ccc([C@@H]2CC(=C3C=C(O)[C@@H]4C(=C3)[C@@H](C)CC3=CCC[C@H]34)c3ccc(O)cc3O2)cc1	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38822	Oc1cc2c3c(c1Oc1ccc4ccccc4c1)C=CC=CC3c1ccc3c(c1O2)OCCO3	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38823	CC(C)(O)c1cccc2c1Oc1cc(O)c(Oc3ccc4ccccc4c3)c3c1C2CCCC3	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38824	CC1Cc2c(ccc(Oc3ccc4c(c3)C=CC(=O)C4)c2CC(=O)O)C2CC3CCCC3C=C12	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38825	COc1cc2c(c(C3=CCOc4cc5ccccc5cc4O3)c1)CC(C1CCCC1O)C=C2	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38826	CC1=C=c2c3c(ccc2=C1)Cc1c(cc(N2Cc4cc(O)ccc4C2=O)c2ccccc12)C3	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38827	CC1CCC2=CC=CC3=CC4=C5CC(c6ccc(CO)cc6)Oc6cc(O)cc(c65)CC4=C1C32	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38828	CCCCC	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38829	C=C1C(=C2CCCCC2)Cc2cc(O)c(Oc3ccc4ccccc4c3)c3c2[C@@H]1CC=CC3	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38830	CCc1ccc(C2CC3=C4C=C(C)C5C=CCC6CCC(c7cccc(c73)O2)C4C65)cc1	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38831	CCC1=C2Cc3cc(O)cc4c3C(=C2C=C2C=CC=CC21)CC(c1ccc(CO)cc1)O4	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38832	O=C(O)c1cccc2c1Oc1cc(O)c(Oc3ccc4ccccc4c3)c3c1C2CCCC3	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38833	Oc1cc2c3c(c1Oc1ccc4ccccc4c1)C=CCCC3c1ccc3c(c1N2)CCCC3	Pocket2Mol	5Q0K	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38834	CC1=C=c2cc3c(cc2C=C1)=C1CC(c2ccc(CC(=O)O)cc2)Oc2cc(O)cc(c21)C3O	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
38835	CC1=CC2=CC=C3c4cccc(Cl)c4OC4CC5=C(C1=NC5)C2C34	Pocket2Mol	5Q0K	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

38821 to 38835 of 73725 items. Total 4915 pages.