Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
53176	O=C1NC=C2C3=CC=C(N4CC4=O)NC3=NC(n3cccc3)C12	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53177	CN1CC2=C(C=N1)C1=CC=CNC1=NC2	SBDD	5W2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53178	CC1=CC=C2C3=CNC(=O)C3C(N3CC(N)C4CC43)N=C2N1	SBDD	5W2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53179	CC1OC1C(=O)NC1=NC2=NC(c3cccnc3)C3C(=O)N=CC3C2C=C1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53180	O=C1CN2C(=CC=C3C2=NC(c2cccnc2)=C2C(=O)N=CC32)NC1=O	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53181	NC1NC=CC2=C1C1=NC3C2=CC=CN3C(CO)OCC(O)/C=C\NCCN1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53182	CC(=O)NC1=NC2=NC3C4=C(C=C(C)NC4(N)Cc4cccn43)C2=CC1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53183	O=C1N=CC2C3=CC=C4NC(=O)C(=O)NN4C3=NC(c3cccnc3)=C12	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53184	NC1NC(=O)C2C(NC(=O)CO)=NC(N3C4CCCCC43)C(C3NC3=O)C12	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53185	O=C(NC1=NC2=NC(c3cccnc3)C3C(=O)N=CC3C2C=C1)C1CO1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53186	O=C(NC1=NC2=NC3c4cnccc4COC4=NCC(C2C=C1)C43)C1CO1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53187	CC1=CC(=O)NC2=CC=C3C(=NC(c4cccnc4)=C4C(=O)N=CC34)N12	SBDD	5W2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53188	CC1NCCC2C1N2c1nc2c(c3c1C(N)NCC=3)=CC=CN2CCO	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53189	CNCCC(N[C]1N=C2N=C(NC=O)CC=C2C2=CNC(C)NC=C12)C1CO1	SBDD	5W2G	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
53190	C=CCCCC	SBDD	5W2G	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

53176 to 53190 of 73725 items. Total 4915 pages.