Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64876	O=C(O)CC(O)CO	TargetDiff	4X5Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64877	O=C(O)C(O)(CCO)C(O)CO	TargetDiff	4X5Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64878	CC1CC(C2CC(C3C=CC(O)=CO3)C3CN=C4CCC(NC(=O)O)=C4N23)CO1	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64879	CC1CCC(O)(O)CC1(C)OC1=C=C2C=CCC(=O)N2N2C(CO)COC(=O)C3C(=O)O/C(=C/1)C32	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64880	Cc1cccc(/C2=N/C=C\N[C@@H]3C(O[C@@H]4CC[C@H]4C)C(=O)N=C(Cl)[C@H]3[C@H]3N=C4C[C@H](ON5CCCOC5=CCF)N=C4N23)c1	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64881	CC(=O)C1(C)CC2/C=C\C/C=C\C3=C4C(=NC3)NC3=C(C=CC=CC3OCN)NC1C42	TargetDiff	4O09	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64882	C=CC1C/C2=C/CCCC3=C(C)N(C(C)(C)C)C(CC)C4CC(C2=C34)C2N=CC=C(O)C12	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64883	CN(C)c1cccc(-n2cccc3oc(=O)nc2-3)c1CC1=CC=C2CC(=O)C3=CC(CO)CC=C1C23	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64884	CC1=C2C3=NC4C(=C=c5ncnc/c5=C/CC#CN4C(C)C2CC1)N(O)C1=C(CC(O)C1)N3	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64885	COC1=CC2C(C=C1OC1CCC3=C1C1(F)OC(F)C(F)(F)C1(F)CC3)C1NC(C)=NC1=NN(CC(C)c1ccc(F)cc1)N2C(=O)N1CCC1.F	TargetDiff	4O09	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64886	CCC(C)N1CC2N3C(=CC=CC3C1CC1=NCC=C3C(O)CCC31)C1(C)CCC(O)CC2(O)C1	TargetDiff	4O09	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64887	NCC1=CC=CC(C2Oc3ncc4ncc(N5CCCC5)cc4c32)C=C1	TargetDiff	5OP4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64888	COC1=CC=CC(=C2CCN=C3CCC4=C5C(=N)CC[C@@H]5C2=C34)C1	TargetDiff	5OP4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64889	N=CC1NC/C2=N/c3cc(ncn3)NCNC21	TargetDiff	5OP4	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64890	CC1N=C2NCNC3=NC(CN3)S([O])([O])NCC3CC4CC(O)C3N4COCC2C(=O)N1C	TargetDiff	5OP4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

64876 to 64890 of 73725 items. Total 4915 pages.