Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64906	NC(=O)C1=CC=CC=CC1S(O)(O)O	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64907	CC(C)O.CC1=CC=C2C(=CC1)P(=O)(O)C1C=CC=C(N(O)P(=O)(O)O)C21	TargetDiff	5U0F	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64908	CC1(C(O)C(=O)O)C(=O)C(N)(C(F)(F)F)C2=C1CC=CC2	TargetDiff	5U0F	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64909	OC=C1C=CC=C2OC3=C(F)CC(O)=C(O)C3OC12	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64910	NC1C(=O)OC2=CC=CCC=C21	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64911	[O]S1([O])CC(O)(O)NC2(O)C(O)C34CC(CO3)C4(C(O)CC3CCCN3)C21	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64912	CC(O)=C1C=CC2=C3C1C=C1CCCC1N3C(=O)C2C.O=[P](O)O	TargetDiff	5U0F	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64913	O=C(O)C(O)c1ccccn1	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64914	NC1C(=O)N(O)C2C(S(O)(O)O)=CC=CC2=C1O	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64915	O=C1CCCC2C1CCC(N1CCCC(C(O)C(O)C(O)(O)C3CCC3C(=O)O)C1)C2O	TargetDiff	5U0F	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64916	CCCCCC=Cc1ccc(N2CCC[C@@H]([C@@H]3C(=O)C[C@H](c4ccc(F)cc4)[C@H]3C3=CCC(=O)C=C3)CC2)cc1	TargetDiff	4OMK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64917	CCCCCC1CCC(Cc2ccc(C(F)F)cc2CC(C)C)C1	TargetDiff	4OMK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64918	CC(O)C=CCCCC(C)C.CC1(C)COC2=C1CC(OO)=CC2	TargetDiff	4OMK	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64919	CCCC=CCC[C@H]1CN=C2C=C[C@H]3C(=C4CC(O)=CC(C[C@@H](C)O)C4=C4C=CC=C[C@H]43)C=C2O1	TargetDiff	4OMK	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64920	CC[C@@H](C)CCC=CCCN1CCCc2c1oc1c(O)c(O)c([C@@H](O)c3cc(F)ccc3F)cc21	TargetDiff	4OMK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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