Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64936	COC1C[C@H]2O[C@]1(F)CCC(O)CCNC(=O)[C@H]1C(=N[C@H]3CC[C@@](C)(O)C3=O)C=CCC21	TargetDiff	6H2Z	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64937	CC(CO)C(=O)OCC(O)C(O)C1C=CCC=C1P(N)(O)(O)O	TargetDiff	6H2Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64938	CC(C(=O)O)C1C=CC=CC2C1C=CCC2C(O)P(=O)(O)O	TargetDiff	6H2Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64939	CC(C[C@@H](C)C1=C2NC3=CC=C[C@H](O)C=C3[C@@H]2C[C@H](C)[C@H]1O)=C(O)[C@@H](C)N[C@H]1C[C@H](CCCN(CC(C)(C)C=O)[C@@H](C)C[C@H](C)NO)CO1.O=C(O)CO	TargetDiff	6H2Z	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64940	CCCC(N)=S.O=C1OC2=C(O)CC=C3OCC(c4ccccc4)C1C32	TargetDiff	6H2Z	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64941	NS([O])([O])N[P@](=O)(O)[C@H](C=Cc1ccccc1C(F)(F)F)[C@H]1[C@@H](C(=O)O)CCC1(F)F	TargetDiff	6H2Z	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64942	Cc1ccc(OCN[C@@H](c2ccccn2)[C@@H]2CCC(=C(O)C(F)(F)C(N)=O)C2)cc1	TargetDiff	6H2Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64943	CC(CC1(O)OC2CCCC2N(NC2C=CCC(N)=C2)C1=O)C1CCS(O)(O)OC1C	TargetDiff	6H2Z	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64944	COC(C)c1cccc(OCC(O)C2CON3CN=CC4C(=O)NC(=O)C(=C43)NCC(N)C2O)c1F	TargetDiff	5IKB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64945	CCCOC1C2CON(O)C2=C(O)C(O)C1CP(=O)(O)O	TargetDiff	5IKB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64946	NCC(C(Cc1ccccc1)C(=O)O)C1CC(O)C(O)CCC1CF	TargetDiff	5IKB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64947	CC1C(O)(O)CC(O)C(CO)C2C(CNC2C(=O)O)CC(O)C1(O)O	TargetDiff	5IKB	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64948	NCC1OC(C(=O)O)COC2C1=NCC(O)C2O	TargetDiff	5IKB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64949	NC(CC(O)(O)O)C1CCN=C(C(=O)O)C1Oc1ccccc1	TargetDiff	5IKB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64950	C[C@@H](O)C1C=C(C(N)=O)C(=CN)C(C(=O)O)=C1.O=C(O)CCO	TargetDiff	5IKB	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

64936 to 64950 of 73725 items. Total 4915 pages.