Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
64981	OC1c2ccccc2C(O)(O)C1O	TargetDiff	4CST	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64982	CSCC(OC(=O)C(O)CC(CNCC(CF)C(F)C(F)(F)F)OP(=O)(O)O)C(=O)O	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64983	CC(O)C1CC(CC(O)C(O)C(O)CC(O)(OC(=O)CO)C(C)O)CC(C(=O)NF)O1	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64984	CC(CP(O)(O)(F)F)C(C1=N[C](C(=N)CO)N1)C(O)C(O)C1=C(CF)CC(C)(O)CC1	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64985	N=C1CC(=N)C(CC[C@H](OC=C(C(=O)O)[C@H](CF)[C@@H](O)C(=O)O)P(=O)(O)O)=[C]C(=O)N1	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
64986	CC(O)C1OC(=O)C(O)(O)C2NC(COC2C(O)CC2CCCNC2=O)C1(O)C(F)F	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64987	NC(N)=NNC[C@@H]1C/N=C2/C(Cl)=CCC=C2CC(O)(O)C1	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64988	CCC(CCC(O)CCOC1C2=C(CC1O)NC(=N)C(O)(F)C2)C(=O)NP(=O)(O)OO	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64989	NC(N)=NC1=CCN=C(N([C@H]2O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]2O)P(=O)(O)O)C1	TargetDiff	5ITO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64990	CC(C1=NC(=N)C(=N)NC1=O)C1CCC(O)C2CCCC(O)C2CC(O)(O)C1F	TargetDiff	5ITO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64991	O=C1CC2CC3C4CCC5(O)CC(O)C6C(C(F)F)CC(=C2C3C6C45)C(O)(O)N1	TargetDiff	4YYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64992	O=C1C[SH](O)(O)(O)C(=O)N1	TargetDiff	4YYT	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64993	CCC12CC(C)c3cccc4c3N1C(O)(C(=O)N4)c1ccccc12.NS(=O)O	TargetDiff	4YYT	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64994	O=C(O)C1=CCC=CC1OC(F)(F)F	TargetDiff	4YYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
64995	CC1C2C3COCC3CCC3CC4(CCC(O)C(O)(O)C14)CC32	TargetDiff	4YYT	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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