Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
65011	O=C(O)C(c1ccccc1O)C(O)C1OCc2cccc(=O)n2O1	TargetDiff	5OD1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65012	[O]P([O])OC(CNC(O)(CO)C1C=CC=C2C1=CC=CC2F)OCC(O)C1CCOC1	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65013	COC(CC(=O)NC(OC(C)=O)c1ccc(C(=O)O)cc1)C(CF)c1ccccc1-c1ccccc1	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65014	Cc1cc(C(CO)c2ccccc2CS(O)(O)O)ccc1P(=O)(O)O	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65015	CN(C(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C=CC1=C(C(O)C(=O)O)CCC1)c1ccccc1	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65016	O=C(O)C(CO)CCC(C(=O)O)C(C(=O)O)c1ccccc1	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65017	O=C(O)OCCCCC(F)CCCCCNCC1=C(O)CCC1	TargetDiff	5OD1	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65018	CC1CC(O)CCC1C(=O)NC(=O)CC1C=CCC(=O)C1O	TargetDiff	5OD1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65019	CCC(C)=O.CCCCC(N)CCC(O)CN1C=C(C)Cc2cc(F)ccc21	TargetDiff	6HAX	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65020	CN(C(=O)OC(CCCO)C1(C)CC2CCC(=O)CCC2C1O)C1=CC=CC(Cl)C=C1	TargetDiff	6HAX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65021	CCCC(C)C(C)CCC(N)C1NC(C(C)OC)C(C(C)(O)CCN(C)C(C)CO)O1.Cc1ccccn1	TargetDiff	6HAX	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65022	CCC1C(=O)N2C(=O)C(C(Cc3ccc(O)cc3)C3C=CCC(O)=C3)CC(OC)C2C(C)CC1O	TargetDiff	6HAX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65023	CC1COC2C3CCCCCC3CC2C(C)(C(=O)O)OC2CC1C(O)C2C(C)CCN	TargetDiff	6HAX	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65024	CC(C)C.CCC(C)C1CC2N(C(C)=O)CC3C(C)CC(C)C4=C(C1c1ccccc14)N32	TargetDiff	6HAX	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
65025	CCCCC=CCCN[C@H](CCC)C1=C=C/C=C(/C2(CCCC)CCCC2)C(OC)CN1	TargetDiff	6HAX	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

65011 to 65025 of 73725 items. Total 4915 pages.