Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67291	NC(=O)c1ccc2c(c1)C(=O)C(C1CC(CO)N1)C2	TargetDiff	4YHO	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67292	CC1=NC2=C=C/C=C(/N)C=C=C(C(=O)NC3=NCCCO3)C2=CC1	TargetDiff	4YHO	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67293	O=C1C=CCC2=C1NCC(C1C3CCCN3C3CCCN13)C2=C=C1C=CCC=C1	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67294	CC1=NC(=O)C(O)=C2C1=C1CC=CC=C1CC(C)C2O	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67295	CN1CC2C=CC3C=CC2CC(NC2=C4C(=NC(=O)C5=C4CC(N5)C(=O)NC4CCCCC4O3)C(=O)N=N2)c2cccc(O)c21	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67296	COC1CN=C2NC(=N)C3=NC(=C=O)C4=c5ccncc5=C(NO)C4C1=C23	TargetDiff	4ZZZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67297	CCC1CC(O)C2C(NC)=NC(N3C4=C(C=CCC=C4)c4ccc(F)c5c4N3C=NC5)C(C)C12	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67298	COC1CC2CC3C=NC(=NC=C3O)CCCC(C3CC(O)C(C)OC3CC3(C)CC4CCCCC3O4)CCC3CC4C=NOC5=C4C(CC5)CC1C2O3	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67299	CC1=C2CC(=N)NC(=N)C3CCC(C3)OCOCC3NCCN4CN(N=N1)C2C34	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67300	CC12CCC(CCC(O)C3C=CCC(=C3)NC3CNC4=CN=C(N1)C(N)C43)C2	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67301	CCN(CC1NCC/C=C\C=C=C2C(=O)c3c(NCCNC(=O)O)ccc(O)c3C2C1=C=O)C(=O)O	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67302	CC1=CCC=C2N/C1=C1/NC3=C4C1N/C=C(/NC(C)CCNC(=O)CN4CC3=O)C2=O	TargetDiff	4ZZZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67303	CC1=C(O)C=CC(CCC(O)(O)C(=O)Nc2ccncn2)C1C	TargetDiff	5T9U	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67304	CCCC1C(O)C(CC(CCO)OC(N)=O)C(O)C(C)C1C(C)=O	TargetDiff	5T9U	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67305	CC1=CC=CC(Cc2ccccc2NS([O])([O])C2C=CC(F)=CC2O)C(Oc2ccccc2F)C1	TargetDiff	5T9U	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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