Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
67441	CC1CCC(O)C(NN(CC2C=CCC=C2)C(=O)C2C=CCC=C2O)CC1	TargetDiff	6FCJ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67442	CC(C)C(O)C(C)CC1CC(O)(CNCCCN)OC(C(CO)C(O)(F)F)C(O)C1CC(F)(F)C(N)=O	TargetDiff	5O9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67443	CC(C)OC=C1OCC[C@]12C[C@@H](O)[C@H]([C@H]1C=CN=C3N=CCN=C31)CO2.O=C(O)[C@H](O)[C@H](CO)NC[C@@H]1CCO1	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67444	COC1=C2CN(C(=O)CO)C[C@H]2c2cc(F)cc([C@@H](C)C[C@@H](O)[C@H](O)CC=NP(O)O)c21	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67445	CC(C)C1=CN=C2CC3/N=C\COC4=C/C(=C(/O)C(O)/C=C5\C=CC=C6CCC(=NC65)C3C(=O)C3CCC1C23)SC4	TargetDiff	5O9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67446	CN.O=C(O)C1CC(N2COC(O)C3OCCC32)CC(C2CCNC2=O)=[S]1.O=C=O	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
67447	CC(O)C1CC2C(C(=O)O)C3=C(CCC4COCC4CC3)C2C1(O)C(O)C(C)CNCO.O=C(O)C1=CCC(CCO)OC1	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67448	COC1CC(F)=CC=C1N(CCNC(C)=O)C1CC=CC2C(C(=O)O)CC(C(F)(F)F)C21	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67449	CCCC(O)CCC1c2ccc(F)c3c2C(CN1C(O)C(O)C1COC1)N=C(OCC)N3	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67450	CCCOCC1OC(C(CO)C2=C(OC)C=CCC(O)=C2)CC1O	TargetDiff	5O9O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67451	CCCCC(C)N1CC(O)CC(OC(=O)C2OC3C(C(=O)CC(C)CC(N)=O)C(O)C(O)C3(O)C(O)C(C)(O)C2CC)C1=O	TargetDiff	5O9O	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67452	CCNC(=O)c1ccc(N)cc1O	TargetDiff	5N17	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67453	CCCC1CCCNC(O)(OC2CCCC(O)C2)C1	TargetDiff	5N17	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67454	ClC1=CCC2=NC3C4=C(C=CCC=C4N4CCCC34)C2=C1	TargetDiff	5N17	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
67455	O=C(c1ccc(F)cc1)C1NCC2=CCC(O)=CC2C2C=NC=CC12	TargetDiff	5N17	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

67441 to 67455 of 73725 items. Total 4915 pages.