Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
68641	CC(O)C(O)COCC(O)C1(O)CC(C(O)O)CC(OC(O)CO)=C1O	TargetDiff	4RA1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68642	OC1OC2N=C(N3CC4CCCCC4C3)C(O)C(O)C2O1	TargetDiff	4RA1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68643	OC1C(CC2CCNCC2)NC2C(CCC3CCCO3)C3CCCC(F)OC3C(O)C12	TargetDiff	4RA1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68644	CC(O)C1COC(N2CCC(C(C)C(=O)O)C2=O)CC(O)O1	TargetDiff	4RA1	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68645	CCCC(C1C=CC=C(C(=O)O)C=C1)C(N)(O)O	TargetDiff	5EWA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68646	CC1(O)C(O)C2CCC1C1C(O)=C(O)C(P(=O)(O)O)C3CC=CC2C31	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68647	CC1C2CCCCC2CC1(C(=O)O)C1SCC(O)(CC(O)C2CC(O)OC2O)OC(=O)C1C(=O)O	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68648	OC1C(C(O)(O)c2ccccn2)C2=CC=CCC=C2C1(O)O	TargetDiff	5EWA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68649	O=C(O)CC1(O)C(O)C(=O)OC1C(=O)O	TargetDiff	5EWA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68650	O=C(O)C1C=CC=C(C2(O)CCCC2O)C1O	TargetDiff	5EWA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68651	CC(C)CCC(CCC1CCC2Cc3cc(O)ccc3C(=O)C12)P(=O)(O)O	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68652	CCCCCC(C)(C)C(O)CCOC1(C(=O)O)CNc2ccccc2NC1=O	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68653	C[C@H]1CN2C[C@@H](CO)[C@H]([C@@H]3C=CC(=CNN)C=C3C(=O)O)C2=CO1	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68654	CC(O)=C(C(=O)N(O)C(=O)C1=CC=CCC(F)=C1)[C@@H](C)[C@@H](C)[C@@H](C)C(=O)O	TargetDiff	5EWA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
68655	C[C@@H]1C[C@@H](S(O)(O)O)[C@H](C)C1=C1COCC2=C(C1)[C@H](N[C@H]1CC[C@@H](Cl)CC1)[C@@H](C(=O)O)C(O)=C2	TargetDiff	5MWY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

68641 to 68655 of 73725 items. Total 4915 pages.