Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
6856	CN1CCN(c2ccnc(Nc3cc(-c4ccc(F)c(F)c4)ccn3)n2)CC1	AlphaDrug	5J6M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6857	CC1CCCN(c2ccnc(Nc3cc(C(N)=O)ccc3OCC(=O)NC3CC3)n2)CC1	AlphaDrug	5J6M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6858	CNC(=O)C1CCC(Nc2cc(-c3ccc(F)cc3)ccc2C(F)(F)F)C1	AlphaDrug	5J6M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6859	CC1CCN(c2ccnc(Nc3cc(-c4ccc(F)c(F)c4)ccn3)n2)C1	AlphaDrug	5J6M	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6860	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(N3CCN(c4cccc5ccccc45)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6861	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(-n3cnc4c(N)nc(-c5ccc(Cl)cc5)cc43)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6862	Cc1[nH]c2ccccc2c1CN1CCN(c2cc(NS(=O)(=O)c3ccc(C(C)(C)C)cc3)ccc2Cl)CC1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6863	CC(C)(C)C(=O)NCC(=O)NC1CCCCC1NC(=O)c1cc(NS(=O)(=O)c2ccc(C(C)(C)C)cc2)ccc1Cl	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6864	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(N3C=CCC(NC(=O)c4ccccc4)CC3)cc2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6865	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(N3CCN(c4[nH]c5ccccc5c4-c4ccccc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6866	CC(C)(C)c1ccc(-c2nc(Nc3ccc(S(=O)(=O)N4CCC5(C6CCCC6)CCC(C4)C5)cc3)nc3ccccc23)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6867	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(N3CCN(c4ccc(Nc5nccc(C(F)(F)F)n5)cc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6868	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(N3C=CN(c4ccc(OC(=O)Nc5ccc(F)cc5)cc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6869	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccc(Cl)c(N3CCN(c4cccc5nc(N)ccc45)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	6STL	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
6870	CC(C)Oc1cc(-c2ccc(C(=O)Nc3ccc(C(=O)Nc4ccc5ncn(C(C)C)c5c4)cc3)cc2)ccn1	AlphaDrug	6FZ4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

6856 to 6870 of 73725 items. Total 4915 pages.