Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69166	CC[C@@H]1CCCC(C(=O)O)CCCC[C@@]12C(=O)N1CCC(=CC(C)C)Oc3ccccc3[C@@H]3C[C@@]2(O)[C@@H]31	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69167	CCCCCCC1C2CCCC1(O)C(NC)C(C(CC)c1cccc(F)c1)C2=O	TargetDiff	4MC6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69168	CCCC1=C(NC(C)=O)CC(=O)NC1.O=C(C=CO)NOC1=CCC([C@H]2CCCN2)=CC1	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69169	CN1CCN(C)C2=C(CN3C(=N)NC4=CCc5ccc(cc5C43)C1=O)C1=C(/C=C\C=C(NC=N)/C=C\1)C2.OCN1CCCC1	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
69170	CC1O/C(c2ccccc2C2CC=CC(=O)NC2)=N/CC(O)CNCC2CCC(C2)C(=O)OCCC1(C)C	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69171	CCC.C[C@@H]1CC[C@@H]2CC[C@@H](C2)Oc2c(C(=O)O)ccc3c2[C@H]1C=C(O)C3=C1CCN2CCN=C12	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69172	O=C(NO)C1NN(C2CCNCC2)C2=NCC3C=CC(C4C=CC5=CCC(O)=CC5=C4)C(O)C3C21	TargetDiff	4MPN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69173	CC1C2CCCC3OCCC3=C2/C=C/C(=O)NOC2CC(=O)OC(C)(C)C(C)C2C1C	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69174	CNC(=O)[C@H]1CCC(=c2ccc3c(c2O)OCOC=3)C(=O)N1	TargetDiff	4MPN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69175	CCN(C)CC1CC2=C(CC3=C(C=C2)C=NC2=C=C4N=CCN=C4CC23)C1=C=O	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69176	CC(=O)C1(C)C(=O)CC2CC(C(C)(CCF)C3CC4CC(C)(O)C4C3)C(O)C(O)(C(OCC(C)O)C(O)COCO)CC21	TargetDiff	4MPN	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69177	OOC(CN1CCCC1)C1=CC=CC2=C3C=CC4=NCCN=C4C3CC12	TargetDiff	4MPN	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69178	O=C1C2CC(O)CC(CCCC3=NNC(C4=CCC(F)=CC4)=CC13)O2	TargetDiff	5IOZ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69179	C1=CCC(N2CCc3c(N4NCC5=C4CCC5)noc32)=CC1	TargetDiff	5IOZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69180	CC1=C(CC2CCCN2)C(=O)N2CCC3NCCC3C(C)CC2C1	TargetDiff	5IOZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

69166 to 69180 of 73725 items. Total 4915 pages.