Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
69151	N=C1CCC(CS(O)(O)O)C(N)C(=O)N1	TargetDiff	5NEA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69152	O=C(C1=C(NCCO)CC=CO1)S(O)(O)O	TargetDiff	5NEA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69153	CC(O)(O)C1CCC/C=C\C2=C1C(=O)NS2([O])[O]	TargetDiff	5NEA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69154	Cc1cc(O)c(C=N)c(Cl)c1O	TargetDiff	5NEA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69155	Cc1cc(C(=O)O)ccc1C(=O)O	TargetDiff	5NEA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69156	O=C1Oc2ccccc2C(C(O)C(O)O)C1(O)O	TargetDiff	5NEA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69157	CC1C(=O)CCC1S(O)(O)O	TargetDiff	5NEA	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69158	CCCCC(c1ccc(F)cc1)N(CC(C)C(O)C1CC=C(O)CC1)C(=O)O	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69159	CCCC(SCC(C)CC)C(O)C1CCC(C2=CCC=CC2)NC1	TargetDiff	4MC6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69160	CCNC(=O)C(CC(C)C)C(CO)C1=CCC(=O)N=C1C	TargetDiff	4MC6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69161	CC(=O)C(C)CNC1=NC(=O)C(c2ccccc2)C(CCOCCO)CC1O.c1ccccc1	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69162	CCC1SC(C(C)C)CC2(O)CC(C)CC(C3CCC3)C2C1O	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69163	CC=CC[C@H](C[C@@H](C)CC)[C@@H](O)[C@]1(C(=O)O)OC[C@H](O)[C@H]2CCCC[C@@H]21	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69164	C[C@H]1[C@@H]2CCC[C@H]2N(C(=O)N=C(CNC2=CCC=CC2)c2ccccc2)[C@]1(C)O	TargetDiff	4MC6	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
69165	CC(=O)OCC(C)O.OC1CC(CC(C=S)c2cccnc2)C(Cc2ccccc2)C1(O)NC1CCCC1	TargetDiff	4MC6	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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