Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
70246	CN1c2ccnc(n2)OC2C(CC(Cl)=NC2OC2CCCC2)CN(c2ccccc2)OS1(O)O	TargetDiff	5WQC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70247	OC1(O)N=C2C3CCCC/C=C(/Cl)CCC/C=C(/Cl)C=C=C(N1)C2NC3	TargetDiff	5WQC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70248	CCC(C)C1=CC(C(O)(c2cccc(C)c2)C2CCOC2)C=C(F)C(F)=C1	TargetDiff	5WQC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70249	COC1=CC(C2C(=O)C(OC)C3=C2C2C=CCC=CC2=C(C)N3)C=C(C)C1C	TargetDiff	5WQC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70250	CCCCC1CC/C=N\C(N(C)C(C)C)C/C=C2\N=C(O/C=C3\CC1C=CC3C)C(C)S2	TargetDiff	5WQC	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70251	CCCCC(O)=C[C@H](O)C[C@@H](O)C(CO)CO.Cc1cc(F)c2c(c1)O[C@@H](CO)NC1=CC[C@H](C)N[C@H]12	TargetDiff	5WQC	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70252	CC1=C(C)C(c2ccccc2C(C)C2C=CC=CC=C2)=C(NC(N)=O)C1	TargetDiff	5WQC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70253	CCC(C(=O)NC[C@H](C)NC=CC1=CC=CC(C)[C@H]1C)[C@@H](CC)C1C=CC=CC=C1	TargetDiff	5WQC	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70254	OC1CCCCCCCCCC2CCC2c2nc3c(cccc3n2-c2ccc3c(c2)CCCC3)NC1	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70255	CC1=C(C(=COc2ccccc2CCc2cccc3c2C=CCC=C3)NC(=O)O)NCC1	TargetDiff	6GNP	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70256	CC1=C(C)N(C(=O)Nc2ccc(C)cc2)c2ccccc2CN1	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70257	CCC	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70258	OCc1c(O)cccc1O	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70259	OC1=CC(C2C=CCC=C2)C=CC1O	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70260	CCCCCCO	TargetDiff	6GNP	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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