Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
70411	C[C@@H](O)[C@@H](O)C(C(O)C=CC(=O)O)[C@@H](c1ccc2c(c1O)S[C@H](C(=O)O)C2)C(F)F	TargetDiff	6GON	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70412	C=CC1C=C(C=O)C(F)=CC(N([O])[O])=C1O	TargetDiff	6GON	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70413	CCOCCC1N(C2=CC(C)CCC2)C(=O)C(OC2=CCC=C(O)C2)CC1(O)c1ccccc1	TargetDiff	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70414	CC=C[C@H](CCCCc1ccccc1)OC[C@H]1C[C@@H]2c3ccc(O)cc3C=C=CC[C@@](O)(N1)[C@H]2O	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70415	CCC(O)C(COC1COC(O)C1)C(CP(O)O)C(O)CC(O)C(N)=O	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70416	CCCC1(CO)CC(O)C(CCCCCCN)C(=O)N(c2ccc3c(c2)CCCC(O)CN3)C(=O)N1	TargetDiff	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70417	OCCCC=C[C@H]1[C@@H]2CCCC[C@@]2(O)[C@H](CCCO)[C@@H](O)[C@@H]1O	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70418	CCC(C)OCP(=O)(OCC(C)C)OC(CC(C)C)C(N)C(O)CCn1ccc(O)cc1=O	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70419	CCCCC(CO)C(O)C1COCCOCC(O)C2=C(CO)CC=C(C2)N1C(=O)O	TargetDiff	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70420	CCCNC(=S)[C@H](O)C(=N[C@@H](CCC1C=CC=CC1)[C@H](C)C=CC(=O)O)N[C@H](C)CC	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70421	CC(O)C(O)C(OS(O)(O)c1ccc(C(=O)O)cc1)C(O)C1(Nc2ccccc2)CCC1	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70422	CC1=CC(C)C(O)=CC1=C=C(CC(C)C)C1C(O)CC(C(O)C(C)O)C(O)(C(C)C(=O)O)C1(O)O	TargetDiff	6DH2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70423	COc1cccc(N)c1	TargetDiff	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70424	O=C1NCC=Nc2ccccc21	TargetDiff	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
70425	O=C1CCC(O)C1	TargetDiff	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

70411 to 70425 of 73725 items. Total 4915 pages.