Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
71881	N=C1CC(Cc2ccccc2)C(C(F)CC(F)F)N1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
71882	COC(=O)C1=C[C@H](C(=CCC(C)(O)O)[C@@H](C)NC=O)C=CC=C1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71883	CCCC1OC(=O)CCC1OCC1CC(=O)CCC=C1NO	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71884	CC1CCN(C2=CC3=C(C=C(NCC(=O)O)C2)CC(C(=O)N(C)C(C)C)C3)CN1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71885	C1=CC2C=CC3=C(CCCC3)C2=C1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
71886	CCC=CC1=C(CCO[C@@H](F)C(F)[C@H](CC(F)F)C(F)F)OC(=C2C=CCCC2)C1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
71887	CCC1=NC(O)(c2ccccc2OC)NC(C(=O)C2C=CCC=C2N)=C1	TargetDiff	5G4O	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71888	C=S1[SH](S)O[SH]1PS	TargetDiff	2RHY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
71889	COCC1CNC2=C1OCCN2	TargetDiff	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71890	O=C(O)CCO	TargetDiff	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71891	NOSSSCPF	TargetDiff	2RHY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
71892	CC(O)CCCO	TargetDiff	2RHY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71893	CC1=C(CCC(C)C)CC(F)=C2C1=C1NCN(C)N1C2C	TargetDiff	2RHY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71894	COC(C)=C1CCN(C2=NC(=C=CC(=O)O)NCC2)N1	TargetDiff	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
71895	CCCOC(C)=O	TargetDiff	2RHY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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