Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73486	NC(=O)C1=NC=NC(C2OC(O)CC2OC(=O)O)=NC1	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73487	O=C(O)C1=CC(=O)N(C(=O)CCOCC(O)OP(O)O)CC=N1	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73488	C=CN(c1ncnc(=O)cn1)C1CC(O)C(COP(=O)(O)O)O1	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73489	CC(=O)N1CC2=C(N1)C(C(O)C(O)C(=O)OP(=O)(O)O)CC2	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73490	OC1CN2C3C=CC(CN4C5=NC(C6=CCCCC6)=NC6=CC=CC(C65)N5CCCC5C5=C4CCC5)CC3CC2C1O	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73491	CC1=NC=C(CC(OP(O)O)C(C)O)C(=N)C1	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73492	N=C1N=CN(C2CC(CC(O)(O)C(=O)O)C(COP(=O)(O)O)O2)C(=N)CN1	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73493	O=C1C2=C3C(=C(O)CC(O)=C3C(O)C1C(O)Cc1ccccc1)NC2	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73494	O=P(O)(O)OCCCCC1=C(Cc2ccc3c(c2)=C(O)C2=NCNCC2N=3)NCC1	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73495	CC(COP(=O)(O)O)C(O)C1C(O)CC2C3=C(N=CN21)NCN3	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73496	NC1=CCC(N2COCOC2)=NC1=O	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73497	CCNC1=NCC(c2cccc(CN(C(=O)COCCNC(C)=O)C(=O)NC(=O)C(F)F)c2)C1	TargetDiff	2JJG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73498	COP(=O)(O)OCC1c2ncc3cccnc3c2CC1O	TargetDiff	2JJG	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73499	O=C1N=c2cc3c(nc2=N1)CNC1=CC(NC=C1)C3C(=O)O	TargetDiff	4M0R	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73500	COc1cc(C(=O)CN)c(O)cn1	TargetDiff	4M0R	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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