Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73426	C=C(O)C(C1=CCC(C(=C=C(O)c2ccccc2)C(N)(O)CO)C(C)C1)C1CCC(OC(O)(F)C2=CCC=CC2)C1O.CC(CCCO)C1=C(O)CC(Nc2cccc(N)c2S(C)([O])[O])C1C	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73427	O=C1OC2C=CCC=C2N1C1CCC(NO)C(O)c2cccc(F)c21	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73428	CCOC1(C)C/C=C2\CN(c3cccc4c3CC=C(F)C4C)C(=O)C2(NCC(=O)O)/C=C/CN2CCC3C=CC1C=C32	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73429	C1=CC2COCN=C(NCCC3NC(C4NCC(C5CC6=C(CCCC6)O5)N4)NO3)C2=CC1	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73430	CCC1CNC(C(=O)C(N=C=O)c2cccc(C3=CC(N)=CCO3)c2)C1	TargetDiff	6EED	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73431	C=C1C2C=CC(C3(O)CCC3)=C(F)C2C(c2ccc(N(C)CC)c(C(=O)O)c2)C(O)C1C(N)=O	TargetDiff	6EED	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73432	O=C(C1C=CCC=C1)N1CCc2ccc3cccnc3c2CC1	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73433	OC(CC1Cc2ccccc2CN1)c1ccccc1	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73434	CC1CC(C)C(C(=O)OC2C(O)C(O)C3C(=O)C4C(=O)CC=CCC4C23)C1=O	TargetDiff	6U5Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73435	COC1Cc2cccc(Oc3ccc(CC(C)Cl)c(O)c3)c2N1	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73436	CN1NC(=O)C2=CCC(Nc3ccccn3)=CC21	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73437	CC(O)c1cc(F)cc(C2C(O)=CC3=C(C2F)N(C(=O)O)C(C)C3)c1	TargetDiff	6U5Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
73438	N=C(NCC1=CC(C2=C(F)CC(F)[C@H](F)C2)=CC(=NC(=C2C=CCC=C2)c2ccccc2)[C@@H]1O)c1cnccn1	TargetDiff	6U5Y	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73439	NC1=CCC2=C3C1=C1C(=O)ON(c4ccc(CO)cc4)C=C1C(=O)C3ON2	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73440	CC1=C2C=CN=CN=C2NC1	TargetDiff	6U5Y	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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