Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73381	ClCCl.O=C1CN=CC2CCNc3cccc(Cl)c3N12	TargetDiff	5OM2	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔
73382	CCN1C(C(N)=O)C=C2C(Cl)=Cc3cccc4c3C2C1C1=C4C=CCC=C1	TargetDiff	5OM2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73383	C=C1C=C=C/C=C\c2cccc(c2)COn2cc(ncc2=O)C2=CC1=CCC2C	TargetDiff	5OM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73384	Cc1ccc2c3c1-c1cccc4c1C=3C1C(=C4)CC=NC3CCOC=2N31	TargetDiff	5OM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73385	CC1NC(CC(O)(F)CCC2OC(=O)C3CCCC3C2O)C2=C1CC(=O)C2	TargetDiff	5OM2	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73386	Cc1nc(Oc2cnc(C)c(CN3CCCC3)c2)c2c(n1)C(C)CCNC2=O	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73387	O=C1N=C2CC=CC3=C4CCCOCC4C4=NC5=C(CC=C(CC6CCOCO6)N5)C1C4=C23	TargetDiff	4IWQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73388	CC(C)(C)C1C2CNCCC3CC2C2CC1C1CC4CCOCOC4C1C(O)C1=C4CC(C(O)C2C3O)C(CCc2ccncn2)C4CC1(O)CN	TargetDiff	4IWQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73389	O=C1OCc2cc3c(cc21)C1=C(C2Cc4cc(N(F)F)ccc4N2)NNC1=NC=C3	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73390	CCNC1CNCC2CCCN2OC2=C3C=C(O)C=C(OC(C)C)C3C=CC21	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73391	CC1CC2C(O)CCN3CCN(c4ccc5c(n4)N4OCCC6CC(CC5C64)C(=O)NC(CO)(CO)C(O)C(O)C(=O)N1)C23	TargetDiff	4IWQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73392	COc1ccc2cc3c(cc2c1)N1CC2COCC2C1C1=NC(=N)NC(=O)C13	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73393	Cc1ccc2c3c1C1C4CCC45CC(O)COC4C=CC(C=C4)C4C=CC=CC4=C=C(N=C3N1C5)NC2=O	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73394	CC1=CC(C2Sc3ccccc3C2C)=C(NN2CNC=C3C(=N)CN=C32)CNC1	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73395	CCC1CCCCc2cc(OCNC(=O)c3cc4c(cc3C)CN(C)C4)c3c(c21)C(=O)OC3CCCC1C=CNC=N1	TargetDiff	4IWQ	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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