Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73411	COc1cc(C2=C3CC4=C(CC=C5CCC(C)N=C54)N3C(=O)C2C2=NCCN=C2)ccc1C	TargetDiff	4IWQ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73412	CCC1=CC(O)C(NC(=O)CC(C)(C)O)C(O)C1	TargetDiff	6EN5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73413	COC(CC(C)(O)C(O)(O)C1(C)CCCCC1C1COCC1CC(C)CCO)C1CCCCC(=O)OC1	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73414	CC1(O)CC2=C(CC(C=N)N2)C(=O)N1CCO.CCC(=O)O.O=C(O)O	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73415	CCCNCC(O)C(O)CC(O)(O)NCC(=O)O	TargetDiff	6EN5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73416	CC(=O)OCCC1CC2CCN(C(O)(CNC(=O)CCCC(=O)O)C(=O)O)C2O1	TargetDiff	6EN5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73417	CCC(O)CCC1CCON1C(=O)NC(CO)C(O)C(CCO)C1(O)CCC(CCO)C1	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73418	O=C(CCC1CC(O)C2C=CCC=C12)NCC1(O)CCC=CC(CC2CCC(O)C2)C1O	TargetDiff	6EN5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73419	CC1CCCC(O)CC1.CCCCCCC(O)CCO	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73420	O=C1OC2C=CCC(C2)/N=C2\NC(C=C(C3=NCNCC3Cl)S2)C(O)C(OO)CC1CCC(O)C1=C(O)CC(F)=CC1	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73421	CC(C)COC1(O)OC(C)C2=C(CC3CCCC(C4CCNO4)N3)C(O)C(O)N21	TargetDiff	6EN5	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73422	COC(=O)C1CCC2C(=O)C3C(N)C(=O)NC4CN(c5cc(F)c(O)c6c5CCN6C)/C(=N/C=C/12)C43	TargetDiff	6EED	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73423	O=c1nc([C@@H]2CC(=Cc3ccc(F)nc3)C[C@@H](C(O)(O)NO)CN2CO)n2n1CCC2	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73424	CC(O)COC1C2=C(C=CC(C(=N)NC(N)=O)C=C2)NC(CC(=O)CN2CCCC2)/C=C\C1C1C=CNN=C1	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73425	CC(CCCNC(=O)C(O)CC(O)C(=O)C1C=Nc2ccccc2N=C1)C1=CC=CCC=C1	TargetDiff	6EED	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

73411 to 73425 of 73725 items. Total 4915 pages.