Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
73336	Oc1ccccc1	TargetDiff	4OWV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73337	CC1CCCCCC1=O	TargetDiff	4OWV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73338	O=C(O)c1ccccc1O	TargetDiff	4OWV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73339	CC1=NC(=N)C(O)=C(C)[C@@H]1CCC1=C(NS(O)(O)O)C(=C(O)C(=O)O)CCC1	TargetDiff	4OWV	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73340	NC(=O)C1CCCO1	TargetDiff	4OWV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73341	CC(C)C1C(O)COC2CC(OC2=O)C(CO)NC(=O)CCCCC2CCC(C2)C(C)C1C(=O)O	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73342	NC1(O)C(O)CCC2C1CCC1(C(=O)O)C(O)CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)Cc3cccc(c3)CCC21	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✖	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73343	CC1(O)C(O)C(O)C(O)C2C3=C(C=CC2CC2C(C(=O)O)CCC(CO)C2O)CCN31	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73344	C[C@H]1CC[C@@H]2C=C(COC(=O)[C@H]3CC(N=Cc4ccccc4)=NN3)[C@@H](CO)C(=O)N2C1=O	TargetDiff	6R1B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73345	CC(O)C(O)C1COC2CC(O)C(O)CC(O)C(C(=O)O)C3OC(CCC3O)C(CO)C21	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73346	COC1C(O)CCOC(=O)NCCNc2ccccc2C(=O)OCN(CCC(C)CO)CCCC(CO)CC1O	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73347	CC1C=NN(C2OC(CO)C(O)C2O)c2ncccc21	TargetDiff	6R1B	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73348	O=C(O)C1CC(C(=O)O)c2cc(-c3ccc(O)c(O)c3)ccc21	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73349	OCC1C(O)=C/C2=C3\CCCC34Cc3ccccc3CC(CCC(O)CCO4)CCC(C(O)F)C1=C2	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✖	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
73350	CC1C2CCC1C1C(O)CCCC3CN(NCc4ccc(cc4)NC(=O)CCC(O)(F)C(O)C(O)C4CC(O2)C(O)(F)O4)C31	TargetDiff	6R1B	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

73336 to 73350 of 73725 items. Total 4915 pages.