Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
8296	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(-c4n[nH]c5ccccc45)ccc3F)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8297	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5cc(F)cc(C(F)(F)F)c5)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8298	O=C(c1c[nH]c2ccccc12)N1C=CC(Oc2ccc(-c3ccc4n[nH]cc4c3)cc2)CCC1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8299	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ccc6c(c5)CCO6)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8300	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ncc[nH]5)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8301	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ccc6c(c5)CCCO6)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8302	COc1ccc(-c2ccc(CNC(=O)c3ccccc3)cc2)cc1C(C)N1CCC(c2cccnc2C)CC1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8303	COc1ccc2c(C(=O)N3CCCC(NC(=O)CCCC(=O)NC4CC4NC(=O)CCCC(=O)N4CCCCC4)CC3)c[nH]c2c1	AlphaDrug	2AZY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8304	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ccc6c(c5)COCCO6)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8305	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ccc(C(F)(F)F)cn5)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8306	CCC(C)(C)N1CCC(c2ccc(C(N)=O)c(-c3cccc(NS(=O)(=O)c4ccc(OC)cc4)c3)c2)CC1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8307	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCCCC4)ccc3C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8308	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(C4CCN(c5ccc6c(c5)OCCCCO6)CC4)ccc3C(N)=O)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8309	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2ccccc2OCC(N)C(Cc2ccccc2)NC(=O)C2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8310	COc1ccc(S(=O)(=O)Nc2cccc(-c3cc(NC(N)=O)c4ccccc4n3)c2)cc1	AlphaDrug	2AZY	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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