Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
8776	Cc1ccc(C(=O)Nc2cc(C)c(C(=O)N3CCCC3)c(O)c2)cc1Cc1ccccc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8777	Cc1ccc(-c2cccc(Cl)c2)cc1CC(NC(=O)OC1CCCCC1)c1ccccc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8778	Cc1ccc(-n2nc(-c3ccc(C(C)(C)C)cc3)cc2NC(=O)NCC(C)(C)C)cc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8779	Cc1ccc(-c2cncc(Cl)c2)cc1CC(NC(=O)c1ccc(-c2ccnn2C)cc1)c1ccccc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8780	Cc1ccc(-c2nc3ccccc3s2)cc1Cc1ccc(C(C)(C)C)cc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8781	Cc1ccc(-c2cccc(Cl)c2)cc1CC(NC(=O)c1cc(-c2ccc(F)cc2)n[nH]1)c1ccccc1	AlphaDrug	5VC4	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8782	CC(C)(C)CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)C(=O)C1CCC(NC(=O)c2cccc3ccccc23)CCN1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8783	CC(=O)c1cccc(CN2CCC(=Cc3cccc(-c4nnc(-c5ccccc5)o4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8784	CC(C)(C)CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)C(=O)C(O)C1CCCN(c2cnc(-c3ccccc3)o2)C1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8785	CC(=O)Nc1cccc(-c2ccc3cccc(C(=O)NC4CCN(c5cccc(C(F)(F)F)c5)CC4)c3c2)c1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8786	CC(C)(C)CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)C(=O)CC(N)C(=O)NC1CCCC(NC(=O)c2cccc3ccccc23)C1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8787	CC(C)(C)CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)C(=O)C1CCC(NC(=O)c2cccc3ccccc23)CNC(=O)c2ccccc2C1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8788	Cc1cccc2c(-c3cccc(NC(=O)C(=O)N(Cc4ccc(-c5ccccc5)cc4)CC(C)(C)C)c3)cccc12	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8789	CC1CCC(NC(=O)c2[nH]c(-c3ccc(CN(CC(C)(C)C)C(=O)NCc4cccc(C(F)(F)F)c4)cc3)cc2O)CC1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8790	CC(C)(C)CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)C(=O)C(=O)Nc1cccc(-c2cnn(Cc3ccccc3)c2)c1	AlphaDrug	5ABA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

8776 to 8790 of 73725 items. Total 4915 pages.