Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
8836	Cc1cc(Cl)ccc1S(=O)(=O)Nc1cc(Cl)cc(OCc2ccc3ccccc3c2)c1	AlphaDrug	5DWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8837	Cc1cc(Cl)ccc1S(=O)(=O)Nc1cc(OCc2ccc3ccccc3c2)cc(Cl)c1Cl	AlphaDrug	5DWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8838	Cc1cc(CN2C(=O)c3cc(C(=O)O)ccc32)cc(Cl)c1C	AlphaDrug	5DWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8839	Cc1cc(Cl)ccc1S(=O)(=O)Nc1cc(Cl)cc(OCc2ccc3cc(Cl)ccc3c2)c1	AlphaDrug	5DWR	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8840	COC(=O)C(Cc1cccc(C(=O)O)c1)NC(=O)c1cccc(-c2cccc(CNC(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cn3)c2)c1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8841	CC1CC(c2cccc(C(=O)NS(=O)(=O)c3ccc(C(C)(C)C)cc3)c2)CC(=O)N1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8842	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)c2c(O)cc(C3(C(N)=NC(=O)c4cccc(C5CC5)c4)CC3)cc2O)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8843	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C3(c4ccc(C(N)=O)cc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8844	COC(=O)C(Cc1cccc(C(=O)O)c1)NC(=O)c1cccc(-c2cccc(C3(c4ccc(C(=O)O)cc4)CCCCC3)c2)c1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8845	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C3(/C(N)=N/C(=O)Cc4cccc(C5CCCCC5)c4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8846	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C3(/C(N)=N\C(=O)Nc4cccc(C5CC5)c4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8847	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2ccc3c(c2)C(NC(=O)c2cccc(C(F)(F)F)c2)C3)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8848	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C3(c4ccc(C(=N)N)cc4)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8849	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C(N)C(=O)NC3CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC3C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
8850	CC(C)(C)c1ccc(S(=O)(=O)NC(=O)c2cccc(C3(c4ccc(C5(C(=O)O)CCCC5)cc4)CCCC3)c2)cc1	AlphaDrug	4RN0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

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