Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
1096	CCc1ccc(-c2cc(NC(=O)c3ccc(CN4CCCC4)c(F)c3)cc(C(=O)N3CCC(C(C)(C)C)CC3)c2)cc1	AlphaDrug	5II2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1097	CCc1ccc(-c2cc(NC(=O)C(C)(C)c3ccc(-c4ccccc4)cc3)cc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	5II2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1098	CCc1ccc(-c2cc(NC(=O)C(C)(C)c3ccc(-c4ccccc4)cc3)ccc2C(=O)N2CCC(N3CCN(C)CC3)CC2)cc1	AlphaDrug	5II2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1099	CCc1ccc(-c2cc(NC(=O)C(C)(C)c3ccc(-c4ccccc4)cc3)cc(C(=O)Nc3ccc(F)cc3C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	5II2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1100	CCc1cccc(CNC(=O)c2cc(-c3ccccc3)cc(C(F)(F)F)c2)c1	AlphaDrug	5II2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1101	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc(Cl)c1O)c1cnn(C2CCCCC2)c1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1102	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2cccc(C(=O)O)c2)cc(Cl)c1O)S(=O)(=O)c1cccc(O)c1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1103	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2cccc(O)c2)cc(Cl)c1O)C1CCC(C(=O)O)NC(=O)c2ccccc21	AlphaDrug	4Z0Q	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1104	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2ccc3c(c2)C2(C)C(=O)CCC2C3)cc(Cl)c1O)C(=O)OCc1ccccc1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1105	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2cccc(O)c2)cc(Cl)c1O)S(=O)(=O)C1CCCCN1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1106	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc(Cl)c1O)S(=O)(=O)c1cc(F)cc(F)c1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1107	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2ccc(C(=O)O)cc2)cc(Cl)c1O)c1c[nH]c2ccccc12	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1108	CC(C)(/C=N/C(=O)c1cc(-c2cc3cccc(O)c3c(=O)n2-c2ccccc2)cc(Cl)c1O)c1ccccc1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1109	CC(C)(CNC(=O)c1cc(-c2cccc(O)c2O)cc(Cl)c1O)S(=O)(=O)CCC(F)(F)F	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
1110	Cc1ccc(-n2cc(C(F)(F)F)cnc2=O)cc1C(=O)NCC(C)(C)c1cncnc1	AlphaDrug	4Z0Q	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

1096 to 1110 of 73725 items. Total 4915 pages.