Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
13276	Cc1ccc(NC(=O)c2ccc(OCc3ccc(Cl)cc3C)cc2)cc1Cl	AlphaDrug	4W9C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13277	Cc1cc(NC(=O)c2ccc(O)cc2)cc(C(=O)Nc2cccc(Cl)c2)c1	AlphaDrug	4W9C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13278	Cc1ccc(-c2cc(Cl)cc(C(=O)Nc3ccc(C)cc3C#Cc3cnn(C4CCCCC4)c3)c2)cc1	AlphaDrug	4W9C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13279	CC1(O)CC2OC1(C)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C=NC4=O	AlphaDrug	4W9C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13280	Cc1cc(NC(=O)c2ccc(O)cc2)cc(C(=O)Nc2cccc(Cl)c2)c1	AlphaDrug	4W9C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13281	CC(C)n1c(C(=O)NCc2ccc(OC(F)(F)F)cc2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13282	CC(C)n1c(C(=O)NCc2cccc(Cl)c2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13283	CC(C)n1c(C(=O)NCc2cccc(Cl)c2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13284	CC(C)n1c(C(=O)NCc2ccc(C(F)(F)F)cc2Cl)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13285	CC(C)n1c(C(=O)NC2CCCCC2C(=O)O)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13286	CC(C)n1c(C(=O)NCc2cccc(N)c2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13287	CC(C)(NC(=O)Nc1ccc(-c2nc(-c3cccc4ccccc34)cs2)cc1)c1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13288	CC(C)n1c(-c2ccccc2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13289	CC(C)n1c(C(=O)NC2CCCC2O)cc2c(N)nc(NC(=O)c3c(F)cccc3Cl)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13290	CC(C)n1c(C(=O)NCc2ncc(F)c(C(F)(F)F)n2)cc2c(N)nc(NC(=O)c3ccccc3)nc21	AlphaDrug	5LNE	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

13276 to 13290 of 73725 items. Total 4915 pages.