Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
13441	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)c3ccc4c(c3)OCCO4)CC2)cc1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13442	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3ccc4nc(-c5cccc(C(F)(F)F)c5)[nH]c4c3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13443	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3ccc4nc(C(=O)O)[nH]c4c3)CC2)c(F)c1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13444	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3cccnc3)CC2)c(Cl)c1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13445	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3ccc4nc(C(=O)O)[nH]c4c3)CC2)c(Cl)c1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13446	COc1ccc(CN2CCC(NC(=O)c3ccc4c(c3)CCCO4)C2)cc1I	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13447	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3ccc4nc(-c5cc6ccccc6o5)[nH]c4c3)CC2)cc1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13448	COc1ccc(C2CCN(S(=O)(=O)Cc3ccc4cc(OC)ccc4c3)CC2)cc1	AlphaDrug	5KAB	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13449	Cc1cc(C(=O)NC(C(=O)NCc2ccc(F)c(Cl)c2)C(C)C)[nH]n1	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13450	Cc1cc(C(=O)NC(c2ccc(-c3cnc(N)c(-c4ccc(C(F)(F)F)cc4)c3)cc2)C(C)C)[nH]n1	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13451	Cc1cc(C(=O)NC(c2ccc(-c3cnc(N)c(C4CCNCC4)c3)cc2)C(C)C)[nH]n1	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13452	CC(C)C(NC(=O)c1ccc(Cl)c(C(=O)O)c1)c1ccc(Cl)c(Cl)c1	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13453	Cc1cc(C(=O)NC(c2ccc(-c3cnc(C4CC4)o3)cc2)C(C)C)[nH]n1	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13454	Cc1cc(-c2ccc(-c3ccc(C(=O)O)cc3)cc2)cc(C(C)(C)C)c1O	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13455	CC(C)Cc1nc2c(-c3ccc(-c4cccnc4)cc3)cc(-c3ccc(F)c(C(F)(F)F)c3)cc2n1C	AlphaDrug	6AJZ	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

13441 to 13455 of 73725 items. Total 4915 pages.