Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
13471	Cc1ccc(NC(=O)c2ccc(F)c(OCC(=O)O)c2)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13472	Cc1cc(C(F)(F)P(=O)(O)O)ccc1C(=O)Nc1ccc(C)c(C(=O)Nc2cc(C#N)c3cncn3c2CC(C)C)c1	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13473	Cc1ccc(Oc2ccc(C(C)(C)C)cc2)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13474	Cc1ccc(NC(=O)c2ccc(Cc3ccc(F)cc3)cc2)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13475	Cc1ccc(NC(=O)c2ccc(C(F)(F)F)cc2C)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13476	Cc1cc(C(F)(F)F)ccc1C(=O)Nc1ccc(C)c(C(=O)Nc2ccc(C#N)c(CCCCC(=O)O)c2CC(C)C)c1	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13477	Cc1ccc(Oc2cccc(C(F)(F)F)c2)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13478	Cc1ccc(NC(=O)c2cccc(Cl)c2F)cc1C(=O)NC1=C(CC(C)C)c2ccccc21	AlphaDrug	5EP7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13479	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(Cl)cc2F)C(C(Nc2ccc(Cl)cc2)C(N)=O)N(C)C(=O)N2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13480	CC(NC(=O)N1CCCCC1NC(=O)c1cc(-c2ccc(C(=O)O)cc2F)c(Cl)cc1Cl)c1ccc(C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13481	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(Cl)cc2F)C(=O)NC(Cc2cccnc2)C(=O)N(C)CC(=O)NCC(=O)NC2CCCCCCC2=N)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13482	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(Cl)cc2F)C(=O)NC(Cc2ccc(OC(=O)c3ccccc3)cc2)C(N)=O)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13483	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(Cl)cc2F)C(=O)NC(Cc2cccnc2)C(C(=O)NC(=O)c2cccc3ccccc23)N(C)C(N)=O)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13484	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(C)cc2O)C(=O)NC(C(N)=O)C(=O)NCc2ccc(Cl)cc2)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
13485	Cc1ccc(NC(=O)NC(C)C(=O)NC(Cc2ccc(Cl)cc2F)C(=O)NC(Cc2ccccc2)C(=O)O)cc1	AlphaDrug	5BTV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

13471 to 13485 of 73725 items. Total 4915 pages.