Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14101	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)N3CCCN(c4nc5ccccc5c(=O)[nH]4)CC3)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14102	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)CCC3(C(=O)NCC(=O)NC(Cc4ccccc4)C(=O)O)CCN(C(=O)OCc4ccccc4)CC3)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14103	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)NC(Cc3ccccc3F)C(=O)NC(Cc3ccccc3)C(=O)O)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14104	CN1CCN(c2ccc(C(=O)NC(C(=O)O)C(=O)NC(Cc3ccccc3)C(=O)NC(Cc3ccccc3)C(N)=O)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14105	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)N3CCC4CCC3n3cc(-c5ccccc5)cnc(cn3C)C(=O)N4)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14106	NC(=O)c1ccc(C(=O)NCCCCCNC(=O)C2(c3ccccc3)CCN(C(=O)c3ccccc3)CC2)cc1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14107	CC1N2C(=O)N1C1COC(CC(NS(=O)(=O)c3ccc(N4CCN(C)CC4)cc3)c3cc(F)ccc32)C1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14108	CN1CCN(c2ccc(S(=O)(=O)C3(NC(=O)c4ccc(C(=O)O)cc4)CCCC3)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14109	CN1CCN(c2ccc(C(=O)NC(C(N)=O)C(=O)NC(Cc3ccccc3)C(=O)NC(Cc3ccccc3)C(N)=O)cc2)CC1	AlphaDrug	5NW7	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14110	CCC(Oc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc(-c2ccc(S(=O)(=O)N3CCCC3)cc2)cc1	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14111	CCCN(c1ccc(-c2ccc(C(C)NC(=O)OCc3ccccc3)cc2)cc1)C(C)C	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14112	CCCNC(=O)c1cc(-c2ccc(C)c(NC(=O)c3ccc([N+](=O)[O-])cc3)c2)cc(S(N)(=O)=O)c1	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14113	CCCNC(=O)c1cc(-c2ccc(C)c(C)c2)cc(S(=O)(=O)N2CN(C)CC2C)n1	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14114	CCCNC(=O)c1cc(C(=O)O)cc(S(=O)(=O)N2CCC(N3CCc4ccccc43)CC2)n1	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14115	COc1ccc(S(=O)(=O)N2CCCC(NC(=O)c3ccc(N4CCOCC4)cc3)C2)cc1	AlphaDrug	4U70	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14101 to 14115 of 73725 items. Total 4915 pages.