Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
14071	CNC1CC2OC(C)(C1OC)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14072	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(-c3cc(C#N)ccn3)ccc2C(=O)N2CCC(N3CCOCC3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14073	CNC1CC2OC(C)(C1OC)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14074	Cc1cc(C(F)(F)F)ccc1-c1ccc(C(=O)Nc2cccc(-c3cncnn3)c2)cc1	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14075	CNC1CC2OC(C)(C1OC)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14076	CNC1CC2OC(C)(C1OC)n1c3ccccc3c3c4c(c5c6ccccc6n2c5c31)C(=O)N=C4	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14077	CN(C)CC(=O)N1CCC(c2ccc(-c3cnc4[nH]cc(-c5cccc(C(F)(F)F)c5)c4c3)cc2)CC1	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14078	COc1cc(C(=O)NCC(=N)N)ccc1C(=O)Nc1ccc(-c2cnc3[nH]ccc3c2)cc1	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14079	CN(C)Cc1ccc(-c2cc(-c3cc(Cl)cc(Cl)c3)ccc2C(=O)N2CCC(N3CCCC3)CC2)cc1	AlphaDrug	5ORK	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14080	CS(=O)(=O)c1cccc(NC(=O)C(Cc2ccccc2)NC(=O)c2cnc(OCC(F)(F)F)cn2)c1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14081	O=C1Nc2ccc(-c3ccccc3)cc2/C1=C/c1cccc(N2CCN(C(=O)c3cccc(-c4ccccc4)c3)CC2)c1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14082	CS(=O)(=O)c1cccc(NC(=O)C(Cc2ccccc2)NC(=O)c2ccc(OC(F)(F)F)c(-c3cc(C(=O)O)ccc3O)c2)c1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14083	Cc1cccc(CC(NC(=O)c2ccc(OC(F)(F)F)cc2)C(=O)Nc2cccc(S(C)(=O)=O)c2)c1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14084	CS(=O)(=O)c1ccc(NC(=O)N2CCC(c3ncc(C#Cc4cccc(F)c4)cn3)CC2)cc1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
14085	CC(=O)C1CC(C(=O)NC(Cc2ccccc2)C(=O)Nc2cccc(S(C)(=O)=O)c2)CN(C)C1	AlphaDrug	6MA5	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

14071 to 14085 of 73725 items. Total 4915 pages.