DrugGen

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

The moleculars that cannot be Kekuleized have been excluded.

Section 3: Detailed Test Result Search

id smiles method pdb id PB valid mol pred loaded mol true loaded mol cond loaded sanitization all atoms connected bond lengths bond angles internal steric clash aromatic ring flatness double bond flatness internal energy protein ligand maximum distance minimum distance to protein minimum distance to organic cofactors minimum distance to inorganic cofactors minimum distance to waters volume overlap with protein volume overlap with organic cofactors volume overlap with inorganic cofactors volume overlap with waters
15436 Nc1ccc(OCC(c2ccccc2)c2ccc3cnc(N4CCC(O)C4)cc3c2)cc1 AlphaDrug 5HCV ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15437 Nc1nc2cc(Cl)c(Cl)cc2c(=O)n1Cc1ccc(-c2ccc(C(F)(F)F)cc2)cc1 AlphaDrug 5HCV ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15438 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(S(=O)(=O)c4ccc(CC(C)(C)C(=O)O)c(F)c4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✖ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✖ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15439 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(CC(=O)Nc4ccc(C)c(C)c4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15440 Nc1ncnc(-c2ccc(-c3ccc(Cc4ccc(F)cc4)cc3)cc2)n1 AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15441 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(S(=O)(=O)c4ccccn4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15442 COc1cc(-c2cccc(C3CCN(CC4CCCCC4)CC3)c2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15443 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(S(=O)(=O)c4c[nH]c5ccccc45)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15444 COc1cc(-c2ccc(C3CC(NC(=O)CC4CCCCC4)C3)s2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15445 COc1cc(N2CCN(C3CCCC(C(=O)Nc4cccc(C)c4)CC3)CC2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15446 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(C4CCCCC4)CC4(CCCCC4)C3)s2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15447 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(S(=O)(=O)N4CCC(C(=O)O)CC4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15448 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(CC(=O)Nc4ccc(Cl)cc4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15449 COc1cc(-c2ccc(C(C)(C)C(=O)NC3CCC(CC(=O)O)C3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔
15450 COc1cc(-c2ccc(C3CCN(S(=O)(=O)c4c[nH]c(N)c4)CC3)cc2)ccc1Cl AlphaDrug 4ZFA ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔ ✔

15436 to 15450 of 73725 items. Total 4915 pages.