Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15406	CCc1ccc(-c2nc(NC(=O)N(C)c3ccc4nc(N)n(C)c4c3)c(O)cc2C)cc1	AlphaDrug	5MKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15407	CCc1ccc(-c2nc(NC(=O)C(Cc3ccc(F)cc3)NS(=O)(=O)c3ccc(F)cc3)ncc2C)cc1	AlphaDrug	5MKS	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15408	CC(CC(C)c1ccc(OC(=O)c2ccc(O)c(C(F)(F)F)c2)c(F)c1)NS(=O)(=O)c1ccc(OC2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15409	CC(C)C1(C(=O)NS(=O)(=O)c2ccc(Cc3ccccc3)c(F)c2)C=CN(C(=O)c2ccc3ccccc3c2)CC1	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15410	Cc1ccc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(OC4CCCCC4)cc3)cc2O)cc1CN1CCC(O)CC1	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15411	Cc1cc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(OC4CCCCC4)cc3)nc2)ccc1O	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15412	Cc1ccc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(SC4CCCCCC4)cc3)cc2OC(=O)c2ccc(O)c(O)c2)cc1C	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15413	Cc1ccc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(OC4CCCCC4)cc3)cc2OCC(F)(F)F)cc1C	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15414	Cc1ccc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(OC4CCCCC4)cc3)cc2O)cc1C	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15415	CC(CC(C)c1ccc(OC(=O)c2cccc(C(F)(F)F)c2)c(OC(=O)c2ccc(O)c(O)c2)c1)NS(=O)(=O)c1ccc(OC2CCCCC2)cc1	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15416	CC(CC(C)(CN)c1cccc(-c2ccccc2)c1)C(=O)C(NS(=O)(=O)c1ccc(OCC(F)(F)F)c(F)c1)c1ccc(Cl)c(Cl)c1	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15417	Cc1ccc(C(=O)Oc2ccc(C(C)CC(C)NS(=O)(=O)c3ccc(OC4CCCCC4)cc3)cc2OCC(=O)C2C=CCCC2)cc1C	AlphaDrug	5YYF	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15418	O=C(O)c1cc(-c2c[nH]nc2-c2ccccc2)ccc1O	AlphaDrug	6MM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15419	CCC(Nc1nc(N)nc2ccc(O)cc12)c1ccc(O)c2[nH]c(=O)n(C)c12	AlphaDrug	6MM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15420	O=C(O)c1ccc(Cn2c(C3CC3)nc3cc(-c4ccccc4)ccc32)cc1	AlphaDrug	6MM2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15406 to 15420 of 73725 items. Total 4915 pages.