Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
15376	Cc1ncnc2c1ncn2-c1ccc(C(=O)NC2CCN(C(=O)CCC(C)(C)C)CC2)c(O)c1	AlphaDrug	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15377	CC(C)(C)CCC(=O)NC1C(=O)C(CC(=O)O)CCC1NC(=O)c1ccc(C(=O)O)cc1	AlphaDrug	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15378	CC(C)(C)CCC(=O)N1CCC(=CC(=O)N2Cc3c(Cl)cccc3C2=O)CC1	AlphaDrug	6DH2	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15379	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc(C(=O)[O-])c5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15380	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc(C(=O)O)c5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15381	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4cccc(-c5ccccc5)c4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15382	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc(C(C)(C)C(=O)O)c5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15383	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(OCc5ccccc5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15384	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc6c5cnn6C)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15385	CC(C)(C)c1ccc(-c2ccc3cccc(C(=O)NC4CCN(c5cccc(C(F)(F)F)c5)CC4)c3c2)cc1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15386	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc(N6CCN(c7cccc(C(F)(F)F)c7)CC6)c5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15387	Cc1cccc(-c2ccc3oc(-c4ccc(-c5cccc(NC(=O)C6CC6)c5)cc4)c(C)c3c2)c1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15388	Cc1ccc(-c2oc3ccc(-c4ccc(-c5cncs5)cc4)cc3c2C)cc1	AlphaDrug	6GGA	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15389	CC1CN(c2cc(O)cc(O)c2O)CCN1C(=O)c1cc(-c2ccc(C(=O)N3CCc4c(O)cccc4C3)cc2F)cc(O)c1O	AlphaDrug	6O5T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
15390	CC1(C)CCCN(c2cc(-c3cc(-c4ccc(O)cc4)c(O)cc3C(=O)c3cccc(O)c3)cc(O)c2O)C1	AlphaDrug	6O5T	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

15376 to 15390 of 73725 items. Total 4915 pages.