Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18376	O=C(CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCOc1cc2c(cc1C(=O)NC1CCN(C3CCC(O)C3)C1)CCC2)NO	AlphaDrug	5OUH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18377	Nc1nc2ccc(-c3cccc4c3nnn4Cc3ccccc3)cc2cc1C(=O)NC1CCCN(C2CCC(O)C2)C1	AlphaDrug	5OUH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18378	Cc1c(C(=O)NCC(=O)NC(C(=O)O)c2ccccc2)ccc(NC(=O)NC(Cc2ccccc2)C(=O)O)c1C(=O)NC1CCC(O)C1	AlphaDrug	5OUH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18379	O=c1n(Cc2ccc(Cl)cc2)c2cc(Cl)ccc2n1C1CC=CN(C2CCC(O)C2)C1	AlphaDrug	5OUH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18380	Nc1nc2ccc(-c3cccc4c3ccn4CC(=O)NCc3ccc(F)cc3)cc2cc1C(=O)NC1CCCN(C2CCC(O)C2)C1	AlphaDrug	5OUH	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18381	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(CNC(=O)c3cccc4ncccc34)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18382	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(CNC(=O)c3ccc(C(F)(F)F)cc3)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18383	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(CNC(=O)c3ccc(N4C=COCC4)nc3)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18384	Cc1cc(-c2ccc(C(=O)NO)c(C(C)(C)C)c2)ccc1CCC1CCCC(C(=O)O)C1	AlphaDrug	5IA0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18385	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(CNC(=O)c3cnc(-c4ccc(F)cc4)o3)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18386	CC(C)(C)c1ccc(N2CCCC2C(=O)NC(=O)c2ccc(-c3ccccc3)cc2)cc1	AlphaDrug	5IA0	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18387	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(N3CCN(c4ccc(C(F)(F)F)cc4)CC3)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18388	CC(C)(C)c1cc(-c2ccc(CNC(=O)c3ccccc3Cl)cc2)ccc1C(=O)NO	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18389	Cn1ccc2cc(C(=O)NCc3ccc(-c4ccc(C(=O)NO)c(C(C)(C)C)c4)cc3)ccc21	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18390	CC(C)(C)c1ccc(-c2cc(Cl)c(C(=O)NO)c(C(C)(C)C)c2)cc1	AlphaDrug	5IA0	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18376 to 18390 of 73725 items. Total 4915 pages.