Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18436	O=C(Nc1ccc(Cl)cc1)N1C=CC(N(Cc2ccc(F)cc2)S(=O)(=O)c2ccc(Oc3ccc4ccccc4c3)cc2)CC1	AlphaDrug	6C85	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18437	O=C1N/C(c2ccc(-c3ccccc3)cc2)=C\C=C(\Cl)CC2CCCCC2N1	AlphaDrug	6C85	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18438	O=C(Nc1ccc(Cl)cc1)N1CCC(N(Cc2ccc(F)cc2)S(=O)(=O)c2ccc(O)cc2)CC1	AlphaDrug	6C85	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18439	O=C(Nc1ccc(Cl)cc1)N1CCC(N(Cc2ccc(Cl)cc2)S(=O)(=O)N2CCCC2)CC1	AlphaDrug	6C85	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18440	Cc1ccc(N2CC(NC(=O)c3ccccc3)C2=O)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18441	Cc1ccc(N2CCN(C(=O)c3cccc(-c4ccnc(N)c4)c3)CC2)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18442	Cc1ccc(-c2cnc(C(F)(F)F)nn2)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18443	Cc1ccc(-c2ccc(N3CCCC3C(=O)NC3CCCCC3C(=O)O)cc2C(F)(F)F)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18444	Cc1ccc(N2CCN(c3ccc(C(=O)NC(C(=O)O)C(C)C)cc3)CC2)cc1C(=O)NCC1CC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18445	Cc1ccc(-c2ccc(N3CCCC3C(=O)NC(CS)C(=O)NCC(C)(C)C)cc2C(F)(F)F)cc1C(=O)NCC1C=CCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18446	Cc1ccc(-c2ccc(N3CCCC3C(=O)NC(CS(C)(=O)=O)C(=O)O)cc2C(F)(F)F)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18447	Cc1ccc(-c2ccc(N3CCCC3C(=O)NC(C(=O)O)C(C)C)cc2C(F)(F)F)cc1C(=O)/N=C/C1CCCOCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18448	Cc1ccc(-c2ccc(N3CCCC3C(=O)NC3CCC4CCC3O4)cc2C(F)(F)F)cc1C(=O)NCC1CCCCCC1	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18449	Cc1c(C(=O)NCC(C)(C)C)ccc2nc(NC(=O)C(C)C)c(-c3ccccc3)nc12	AlphaDrug	5FNU	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18450	CC1(C)CC(C(=O)NCCO)C(=O)Nc2ccc(-c3ccnc(NC4CCN(C(N)=O)CC4)n3)cc21	AlphaDrug	5U6J	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18436 to 18450 of 73725 items. Total 4915 pages.