Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
18976	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc([SH](C)(N)=O)cc1CC1CCCC1	AlphaDrug	4H3C	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18977	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc(-c2ccc(CC(=O)O)cc2)c(F)cn1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18978	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc(-c2ccc(Cl)c(O)c2)c(F)cn1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18979	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc(F)c(-c2ccc(F)cc2)c1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18980	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc(S(N)(=O)=O)cc1Cc1ccc(F)cc1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18981	COc1ccc(S(=O)(=O)N(Cc2ccccc2)C2CCCN(C(=O)C3(c4ccc(P(=O)(O)O)cc4)CC3)C2)cc1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18982	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc(-c2ccc(F)cc2)c2cc(F)ccc2n1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18983	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc(-c2ccc(F)cc2)n(C2CCCCC2)n1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18984	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc2c(c(-c3ccccc3)c1)OCCO2	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18985	COc1ccc(S(=O)(=O)N(Cc2ccccc2)C2CCCN(C(=O)C3CCN(c4cccc(NC(=O)NC(=O)c5ccccc5)c4)CC3)C2)cc1	AlphaDrug	4H3C	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18986	CC1CN(Cc2ccc(-c3cccc(S(N)(=O)=O)c3)cc2)CC(Cc2ccccc2)CC(O)CN1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18987	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc(C(C)(C)C)cc1Cc1n[nH]c(=O)[nH]1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18988	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1ccc(S(C)(=O)=O)cc1Cc1ccccn1	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18989	COc1ccc([SH](=O)(c2ccc(-c3ccccc3)cc2)N2CCN(CC(C)(O)CN)CC2)cc1	AlphaDrug	4H3C	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✖	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
18990	CN(Cc1ccc(-c2ccccc2)cc1)c1cc2c(c(-c3ccccc3)c1)OCO2	AlphaDrug	4H3C	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

18976 to 18990 of 73725 items. Total 4915 pages.