Target

Introduction

We evaluated the molecular generation methods and generated molecules using PoseBusters[paper]. Considering that PoseBusters is also suitable for evaluating molecular docking methods, we only retained indicators that may have reference significance in molecular generation and displayed all evaluation results on this page.

Section 1: An Overview of PoseBusters

Section 2: PoseBusters Filter Waterfall

Section 3: Detailed Test Result Search

id	smiles	method	pdb id	PB valid	mol pred loaded	mol true loaded	mol cond loaded	sanitization	all atoms connected	bond lengths	bond angles	internal steric clash	aromatic ring flatness	double bond flatness	internal energy	protein ligand maximum distance	minimum distance to protein	minimum distance to organic cofactors	minimum distance to inorganic cofactors	minimum distance to waters	volume overlap with protein	volume overlap with organic cofactors	volume overlap with inorganic cofactors	volume overlap with waters
20071	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(=O)c4ccc(F)cc4)cc3)cc(C3CCCCC3)c2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20072	COc1ccc(-c2cc(CNC(=O)c3ccc(F)cc3)c3ccccc3n2)cc1CNS(C)(=O)=O	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20073	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(Nc3ccc(CN4CCNCC4)cc3)cc(C(=O)O)c2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20074	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(=O)c4ccc(F)cc4)cc3)cc(C(=O)NC3CCCCN(C)CC3O)c2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20075	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(NC3CCCC(=O)N3)cc(-c3ccc(C(=O)O)cc3)c2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20076	COc1ccc(C(=O)Nc2ccc(S(=O)(=O)Nc3cccc(NS(=O)(=O)c4ccccn4)c3)cc2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20077	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(=O)c4ccc(CCN5CCCC5)cc4)cc3)cc(C(F)(F)F)c2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20078	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(-n3nnc4cc(-c5cnnn5CCCC(=O)O)ccc43)ccn2)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20079	COc1ccc(C(=O)Nc2cc(NS(=O)(=O)c3ccc(NC(=O)c4ccc(N(C)C(F)(F)F)cc4)cc3)ccc2C(F)(F)F)cc1	AlphaDrug	6HTG	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20080	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1ccc(OCC(=O)O)cc12)c1cccc(OC(F)(F)F)c1	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20081	C=C(c1ccc(N2CCN(C)CC2)nc1)c1c(-c2cccc3ccccc23)[nH]c2ccccc12	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20082	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccnc(N4CCC(N5CCN(C)CC5)CC4)c3)ccc12)c1ccccc1	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20083	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccc(N4CCC(N5CCCCC5)CC4)cc3)ccc12)c1ccccc1	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20084	Cc1nc2c(-c3ccc(C(=O)O)cc3)cccc2c(C)c1C(=O)NC(C)c1c(F)ccc(Cl)c1F	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔
20085	CC(NC(=O)c1cnc2c(c1)[nH]c1cc(-c3ccncc3)ccc12)c1cccc(C(=O)O)c1	AlphaDrug	6UDV	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔	✔

20071 to 20085 of 73725 items. Total 4915 pages.